Vazba nádorového supresoru proteinu p53 na DNA. Vliv superhelicity DNA a postranslační modifikace proteinu.
Cíle projektu
Navržený projekt je orientován na výzkum nádorového supresoru proteinu p53 a na otázky jeho vyzby na DNA. Výzkum tohoto klíčového proteinu je nezbytný pro pochopení jeho mnohonásobných funkcí v buňce a jeho úlohy při vývoji rakoviny. Navržené studie jsouzaměřeny na: (i) vliv postsyntetických modifikací na vazbu tohoto proteinu na DNA a zvláště na nadšroubovicovou DNA, (ii) vliv superhelikální hustoty DNA navazbu p53, (iii) vliv nadšroubovicového vinutí na sekvenčně-specifickou vazbu p53 na různé cílovésekvence obsažené v kovalentně uzavřených kroužcích plasmidové DNA, (iv) adsorpčně/desorpční vlastnosti krátkých peptidů p53, specificky fosforylovaných na biologicky významných zbytcích aminokyselin ve srovnání s nefosforylovanými peptidy. Domníváme se, že modelové studie adsorpce těchto peptidů na elektricky nabitých površích přispějí k lepšímu poznání vlastností komplexních molekul proteinu p53 i vlivu fosforylace na tyto vlastnosti a na vazbu p53 na DNA.
Klíčová slova
tumor suppressor protein p53binding of p53 to supercoiled DNAeffect of p53 postsynthetic modification on DNA bindingelectrochemistry of peptidesp53 core and C-terminal domains
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Masarykův onkologický ústavDruh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Binding of tumor suppressor protein p53 to DNA. Effect of DNA supercoling and protein postsynthetic modification
Anotace anglicky
The proposed project is oriented towards the research of the tumor suppressor protein p53 and its binding to DNA. Better understanding of this key protein is essential for rationalizing its role in the development of cancer. The proposed studies are directed at: (i) the effect of postsynthetic modifications of the p53 protein on its binding to DNA and particularly to supercoiled DNA, (ii) the effect ofthe DNA superhelix density on p53 binding, (iii) the effect of supercoiling on the sequence-specific binding of p53 to different concensus sequences within the circular covalently closed plasmid DNA, (iv) adsorption/desorption properties of short peptides of p53 specifically phosphorylated at biologically important amino acid residues. Proposed model studies of adsorption of these peptides at electrically charged surfaces should contribute to a better understanding the effects of phosphorylation on properties of the complex p53 protein molecules and on p53 binding to DNA.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
FD - Onkologie a hematologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Vazba nádorového supresoru proteinu p53 na DNA je stimulována její superhelicitou, jak u vazby sekvenčně nespecifické, tak i specifické. V této vazbě hrají specifickou roli centrální a C-koncová doména p53 a posttranslační modifikace tohoto proteinu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2001
Ukončení řešení
1. 1. 2004
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2005/AV0/AV05IA/U/N/5:3
Datum dodání záznamu
26. 9. 2007
Finance
Celkové uznané náklady
4 874 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 990 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
2 884 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 874 tis. Kč
Statní podpora
1 990 tis. Kč
40%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
CE - Biochemie
Doba řešení
01. 01. 2001 - 01. 01. 2004