Hydratace a solvatace stavebních jednotek biopolymerů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 8 (SAV02008-A)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
IAA400550808
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Hydration and solvation of building blocks of biopolymers
Anotace anglicky
Non-covalent interactions are very important for structure and dynamics of biomolecules (DNA, proteins). Between these interactions besides H-bonded and stacked interactions between the bases in nucleic acids and amino acids in proteins the environment -water molecules and ions - plays a very important role. The complexes amino acids, short peptides of nucleosides and nucleotides an their pairs with water and ions will be characterized by classical molecular dynamics, mechanics and mainly by the ab initio quantum chemical approaches. After detailed exploration of conformational landscapes of complexes using cheaper methods, the most stable structures will be studied at ab initio level. Geometries (inluding binding sites for water and ions) and exact values of interaction energies will be obtained and the calculated IR spectra will serve for an interpretation of experimental results.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10403 - Physical chemistry
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cíle projektu se podařilo naplnit. Byl objasněn vlivu solventu na tautomerní rovnováhu párů bází, vyvinuta metoda pro neempirické přiřazování charakteristických vibracních frekvencí a byly modelovány interakce DNA čipů s nabitým povrchem a fluorofory.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2008
Ukončení řešení
31. 12. 2012
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2012
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP13-AV0-IA-U/02:2
Datum dodání záznamu
12. 2. 2014
Finance
Celkové uznané náklady
2 022 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 022 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč