Strukturní a funkční charakterizace gigantických rostlinných retrotranspozónů typu Ogre

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA500960702

Název projektu anglicky

Structural and functional characterization of the giant plant Ogre-like retrotransposons

Anotace anglicky

The giant Ogre-like elements represent a novel family of recently amplified and transcriptionally active plant retrotransposons which appear to have a significant impact on genome evolution in many plant species. Besides their extreme length (22-25 kb) they are characterized by several unique structural features which suggest they constitute a distinct group of LTR-retroelements. This project aims at detailed characterization of the Ogre-like elements, which will include their transcription analysis andidentification of regions regulating the transcription, investigation of their specific features (intron sequences and additional open reading frame), and comparative computer analysis of the elements from species belonging to different genera. These experiments will help to elucidate molecular mechanisms allowing efficient genomic amplification of these retroelements and their interaction with the host genomes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu přineslo řadu originálních poznatků o rozšíření, struktuře a biologii Ogre elementů a odhalilo značný vliv této skupiny retrotranspozónů na strukturu a evoluci genomů rostlin.

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

8. 6. 2010

Celkové uznané náklady

2 272 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 272 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč