Jaderná topologie některých protoonkogenů u lidských neutrofilních granulocytů a leukemických buněk
Cíle projektu
Práce bude řešit problematiku topologie C-MYC, ABL a BCR protookogenů v jádrech lidských granulocytů v porovnání s jaderně topografickými parametry zmíněných genů u leukemických buněk, u kterých bude navozena myeloidní diferenciace, během které se mění exprese některých studovaných genů. Bude hledán vztah mezi strukturou jaderného chromatinu a expresí genů nejen v modelových příkladech experimentálně navozené diferenciace leukemických buněk, ale i u pacientů s chronickou myeloidní leukemií (CML). U pacientů bude sledován rozdíl v topologii ABL a BCR genů v období chronické a akcelerační fáze a v období blastického zvratu, kdy se mění exprese ABL genu, který je u této formy leukemie translokován do oblasti BCR lokusu (Philadelphský chromosom). Rovněž bude sledována amplifikace C-MYC genu. Cílem práce je zjistit zda existují rozdíly v topografii studovaných genů u pacientů s CML v porovnání se zdravými jedinci.
Klíčová slova
Chromatin structureterritorial model of chromosomesprotooncogenesFISHRT/PCRgeneexpressionhuman granulocztesin vitro myeolid differentiationneukemic cells
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Masarykova univerzita / Fakulta informatikyDruh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Nuclear topology of some protooncogenes in human neutrophilic granulocytes and leukemic cells
Anotace anglicky
The project will study the topology of C-MYC, ABL and BCR protoocogenes in the nuclei of human granulocytes in comparison with the topology of mentioned genes in leukemic cells that will be differentiated along the myeloid pathway taht is characteristicby changes of gene expression. The relationship between the structure of nuclear chromatin and gene expression will be studied not only in the model differentiation experiments, but also in the parients suffering from chronic myelogenous leukemia (CML).The differences in the topology of ABL and BCR genes will be detected at the time of chronic, accelerated phases and at the time of blastic crisis of CML which differ in the expression of ABL gene that is translocated into the region of BCR locus (Philadelphia chromosome). Amplification of the C-MYC gene will be also assessed. The aim of this work is to find the differences in the topology of some genes that will be detected in the CML patients in contrast with the healthy individuals.
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
FD - Onkologie a hematologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Granulocytární direrenciace bun+k je charakteristická repozicí řady genetických struktur k jaderné membráně. Existují závislosti mezi aktivitou/inaktivitou C-myc, Ab1 a Rb1 genů a přiblížením těchto lokusů k centromerickému heterochromatinu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2001
Ukončení řešení
1. 1. 2003
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2004/AV0/AV04IA/U/N/3:2
Datum dodání záznamu
13. 10. 2004
Finance
Celkové uznané náklady
1 924 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
694 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 230 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
1 924 tis. Kč
Statní podpora
694 tis. Kč
36%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2001 - 01. 01. 2003