Logické strojové učení pro analýzu genomických dat

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 3 (SAV02005-J)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Logic-based machine learning for genomic data analysis

Anotace anglicky

In the current raise of interest in the research on gene relationship discovery from gene expression data by means of machine learning and data mining, logic-based relational machine learning (LBRML) algorithms receive little or no attention, which contrasts with their successes in related biological applications, their strong theoretical foundations, the availability of a plethora of implementations, and mainly the understandability and direct biological interpretability of their outputs. Their littlepenetration is due to the fact that in comparison to statistical approaches currently favored in this application field, LBRML exhibits insufficient robustness agains data imperfection, inefficiency in the attribute-rich genetic domains and insufficientuncertainty modeling features. We will eliminate these algorithmic defficiencies by incorporating probabilistic inference/representation techniques into LBRML and demonstrate experimentally its power in the gene relationship discovery.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

IN - Informatika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly zdokonaleny existující algoritmy relačního strojového učení založené na logice a vyvinuty nové algoritmy použitelné pro účel nalézání neznámých biologických zákonitostí z genomických dat, zejména z dat genové exprese měřených DNA čipy.

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-AV0-KJ-U/02:2

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

286 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

286 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč