Populační struktura a odlišení druhu v rámci Trapeliopsis glaucolepidea agg. založené na multigenovém přístupu DNA-sekvencí

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)

Hlavní účastníci

Botanický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Population structure and species delimitation within the Trapeliopsis glaucolepidea agg. based on multigene DNA-sequence data

Anotace anglicky

The lichen Trapeliopsis glaucolepidea occurs in C and NW Europe and in highlands of central and S America and E Africa. The morphological variation of the species is extremely large and it is difficult to assess whether this variation is due to environmental factors or fixed genetical traits. A molecular analysis of variable sequences from 3 different nuclear and mitochondrial loci (ITS, IGS rDNA, mtLSU) shall be performed on a large sample of thalli covering more or less the complete distributional area of the lichen. Mutual comparison of sequences within and among known areas should inform whether some populations already constitute diverged lineages assignable to species of if gene flow persists. The above mentioned spacers and genes are potentiallyhighly variable. After appropriate evaluation of the dataset, i.e. establishing the distribution pattern of single haplotypes, the history of the evolutionary processes within the group shall be assessed.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tpsis glaucolepidea agg. je variabilní, přesto monofyletická skupina tvořená z geneticky blízce příbuzných linií, možná mikrospecií. DNA data indikují spíše souvislé rozšiřování/fragmentaci areálu nežli náhodnou historickou událost

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-KJ-U/07:5

Datum dodání záznamu

12. 2. 2014

Celkové uznané náklady

1 105 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 018 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč