Trojrozměrná analýza struktury endoplazmatického retikula na základě zpracování obrazů z 2-fotonového a konfokálního mikroskopu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Three-dimensional analysis of endoplasmic reticulum structure based on processing of images captured by 2-photon and confocal microscopy

Anotace anglicky

We will test the applicability and efficiency of methods for estimating the length of ER tubules, their length density in cell, proportion of lamellar sheets in ER, mean size and size distribution of meshes in the ER net, characteristics of ER organization, anisotropy and texture. The quantitative evaluation of such characteristics together with ER three-dimensional reconstruction and visualization will provide a complex and objective information about its structure and thus will help in studies of ER changes, both in normally developing cells and cells suffering from various types of stress. The methods will be tested on GFP-transformed tobacco cells (line BY-2). The ER characteristics wil estimated by contemporary unbiased stereological methods and image analysis techniques applied to three-dimensional image data acquired by 2-photon and confocal microscopy.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20206 - Computer hardware and architecture<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly vyvinuty a implementovány metody analýzy obrazu pro měření délkové hustoty tubulů endoplazmatického retikula (ER) tabákových buněk. Bylo zjištěno, že v časných fázích toxického působení Al iontů a Latrunkulinu B dochází ke změnám struktury ER.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-KJ-U/07:5

Datum dodání záznamu

12. 2. 2014

Celkové uznané náklady

1 767 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 186 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč