Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”
KJB6011309

Trojrozměrná analýza struktury endoplazmatického retikula na základě zpracování obrazů z 2-fotonového a konfokálního mikroskopu

Cíle projektu

Budeme testovat použitelnost a účinnost metod pro měření délky tubulů endoplazmatického retikula (ER), jejich délkové hustoty v buňce, podílu lamelárních struktur v ER, průměrné velikosti a rozdělení velikostí ok v ER síti, charakteristik organizace, anizotropie a textury ER. Kvantitativní vyhodnocení těchto charakteristik spolu s trojrozměrnými rekonstrukcemi ER poskytne komplexní a objektivní informace o struktuře ER, což přispěje k podrobnějšímu studiu jeho změn jak v normálně se vyvíjejících buňkách, tak i v buňkách vystavených různým typům stresu. Tyto metody budou testovány na tabákových buňkách linie BY-2 transformovaných genem pro GFP. Charakteristiky ER budou odhadovány současnými stereologickými metodami a technikami analýzy obrazu aplikovanými na trojrozměrná obrazová data získaná 2-fotonovou a konfokální mikroskopií.

Klíčová slova

endoplasmic tericulum3-D analysis2-photopn microscopyconfocal microscopyimage analysisquantiative evaluationGFP-transformed tobacco cellsstereological methods

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Akademie věd České republiky

  • Program

    Juniorské badatelské grantové projekty

  • Veřejná soutěž

    Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)

  • Hlavní účastníci

    Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Three-dimensional analysis of endoplasmic reticulum structure based on processing of images captured by 2-photon and confocal microscopy

  • Anotace anglicky

    We will test the applicability and efficiency of methods for estimating the length of ER tubules, their length density in cell, proportion of lamellar sheets in ER, mean size and size distribution of meshes in the ER net, characteristics of ER organization, anisotropy and texture. The quantitative evaluation of such characteristics together with ER three-dimensional reconstruction and visualization will provide a complex and objective information about its structure and thus will help in studies of ER changes, both in normally developing cells and cells suffering from various types of stress. The methods will be tested on GFP-transformed tobacco cells (line BY-2). The ER characteristics wil estimated by contemporary unbiased stereological methods and image analysis techniques applied to three-dimensional image data acquired by 2-photon and confocal microscopy.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

    ZV - Základní výzkum

  • CEP - hlavní obor

    EA - Morfologické obory a cytologie

  • CEP - vedlejší obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • CEP - další vedlejší obor

    JC - Počítačový hardware a software

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10601 - Cell biology
    10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
    10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
    10605 - Developmental biology
    10608 - Biochemistry and molecular biology
    10609 - Biochemical research methods
    20206 - Computer hardware and architecture
    30101 - Human genetics

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    Byly vyvinuty a implementovány metody analýzy obrazu pro měření délkové hustoty tubulů endoplazmatického retikula (ER) tabákových buněk. Bylo zjištěno, že v časných fázích toxického působení Al iontů a Latrunkulinu B dochází ke změnám struktury ER.

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2003

  • Ukončení řešení

    1. 1. 2005

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP06-AV0-KJ-U/07:5

  • Datum dodání záznamu

    12. 2. 2014

Finance

  • Celkové uznané náklady

    1 767 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    1 186 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    0 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

1 767 tis. Kč

Statní podpora

1 186 tis. Kč

67%


Poskytovatel

Akademie věd České republiky

CEP

EA - Morfologické obory a cytologie

Doba řešení

01. 01. 2003 - 01. 01. 2005