Strukturní studium interakcí mezi bíkovinami a poškozenou RNA.

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INGO

Veřejná soutěž

INGO 6 (SMSM2008LA3)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

1208/2010-32

Název projektu anglicky

Structural studies of protein-RNA complexes involved in RNA quality control

Anotace anglicky

Cells seem to leave nothing to chance, including the quality control at all steps of information transfer. RNA maturation involves extensive processing that has a relatively high error rate. Cells have developed an RNA quality control mechanism which identifies improperly processed RNAs and subsequently degrades them. This mechanism ensures that only properly processed RNAs are engaged in protein synthesis. The exosome and Trf4 complex are the central molecular machines in this process. The Trf4 complexrecognizes and polyadenylates the aberrant RNAs, whereas the exosome is responsible for their degradation. We propose here to use multidimensional NMR spectroscopy to determine the three-dimensional structure of several protein-RNA complexes that are involved in RNA quality control. The proposed project will reveal the mechanism by which the Trf4 complex identifies the aberrant RNAs and thus recruit them for the degradation machinery.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tento projekt se zabýval studiem mechnismu interakcí mezi proteiny a RNA na strukturní úrovni. Zjistili jsme jak proteiny, které se účastní transkční terminace a editace RNA, rozpoznávají své substráty.Výsledky tohoto projektu byly publikovány ve formě ?

Zahájení řešení

1. 1. 2008

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

3. 12. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-MSM-LA-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2011

Celkové uznané náklady

1 833 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 833 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč