Strukturní studium interakcí mezi proteiny a RNA účastnící se v mechanismu kontroly kvality RNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 11 (SGA02008GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/08/1212

Název projektu anglicky

Structural studies of protein-RNA complexes involved in RNA quality control

Anotace anglicky

To control the quality of RNA biogenesis in the nucleus, cells use sophisticated molecular machines. These machines recognize and degrade not only RNA trimmings-the leftovers of RNA processing-but also improperly processed RNAs that contain defects. Using this mechanism, cells ensure that only high-quality RNAs are engaged in protein synthesis and other cellular processes. One of the RNA quality-control pathways involves the exosome and the Trf4/Air2/Mtr4 polyadenylation (TRAMP) complex. The TRAMP complex stimulates activity of the exosome and recruit its RNA substrates. We aim to study how the TRAMP complex identifies the aberrant RNAs and thus recruits them for the degradation machinery. Here we propose to use multidimensional NMR spectroscopy to determine the three-dimensional structure of several protein-RNA complexes that are involved in RNA quality control apparatus. The project is focused on interactions of the RNA-binding subunits of the TRAMP complex and Trf4 with RNA substrates. The

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Proteiny vázající RNA hrají důležitou roli při biogenezi RNA. Tyto proteiny rozpoznávají specifické sekvence RNA, rekrutují různé enzymy na specifická místa, řídí sbalování RNA do správných 3D konformací, nebo se například nespecificky nabalují na RNA a?

Zahájení řešení

1. 1. 2008

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-GA0-GA-U/03:3

Datum dodání záznamu

9. 2. 2015

Celkové uznané náklady

6 990 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 490 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

4 500 tis. Kč