Zvýšení úspěšnosti primárního skríningu biologicky aktivních látek pomocí výpočetních modelů

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

INTER-EXCELLENCE 12 (SMSM2018LTARF)

Hlavní účastníci

Univerzita Palackého v Olomouci / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-5727/2018-2

Název projektu anglicky

Improve the output of primary screening of biologically active compounds using computational models

Anotace anglicky

The aim of the current project is the development and experimental validation of new chemoinformatcs tools that will help to increase success rate of primary biological screening taking into account molecular activity, side activity and metabolic stability. We follow four main directions of the Project: • Development of the tools for unsupervised selection of diverse libraries of compounds for general purpose high-throughput screening based on data set visualization using advanced dimensionality reduction techniques and 2D molecular representation, and the one based on representation of molecules using 3D pharmacophores, • Development of the tools for creation of focused sets of compounds potentially active against a particular target using two strategies: - selection of compounds from available libraries based on 3D ligand- and structure-based pharmacophores, - generation of virtual focused libraries by enumeration of fragment replacements of a given seed compound(s) leading to a desired potency change. Approach will use Matched Molecular pairs for enumeration of possible fragment replacements and machine learning techniques for potency change prediction, • Development of tools to predict compounds with undesired pharmacological profile (high promiscuity, off-target activity) and chemically unstable compounds to exclude them from screening, • Validation of developed approaches in retrospective studies and their application to real drug design projects devoted to development of MARK4 inhibitors, ligands of cannabinoid CB1 receptor and ligands of adenosine receptors.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10401 - Organic chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

30107 - Medicinal chemistry

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CC - Organická chemie<br>FP - Ostatní lékařské obory

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Pomocí vyvinutých technik a nástrojů pro modelování farmakoforů bylo nalezeno 5 adenosinových antagonistů a 2 MARK4 inhibitory. Dále byly vytvořeny webové aplikace predikující možné cíle sloučenin, jejich stabbilitu a design specifických knihoven. Metoda pro generaci chemicky rozumných struktur byla vytvořena a aplikována na design inhibitorů hlavní proteázy SARS-CoV2.

Zahájení řešení

10. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 2. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-MSM-LT-U/01:2

Datum dodání záznamu

1. 7. 2021

Celkové uznané náklady

7 803 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 803 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč