Validace taxonomick0ho DNA microarraye a určení bakteriální diverzity v půdě.
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
M2 - Mezinárodní spolupráce
Číslo smlouvy
9113/2008-32
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Validation d'une puce à ADN taxonomique et caractérisation de la diversité bactérienne du sol.
Anotace anglicky
L'objectif est de valider une puce à ADN taxonomique pour caractériser (génotyper) la biodiversité bactérienne de milieux complexes. Cette puce est constituée de sondes pour le gène rrs (ADNr 16S), qui est le principal marqueur génétique utilisé pour caractériser les bactéries. Cette approche puce a été initiée à Lyon et à Prague avec un prototype de presque un millier de sondes, qui ciblent les bactéries à différents niveaux taxonomiques, allant des grands phylas aux genres etespèces. Le projet consiste à développer ce prototype, afin d'atteindre plus d'un millier de sondes, et à le valider pour explorer la diversité bactérienne dans les sols. Les échanges seront particulièrement importants pour harmoniserles solutions techniques déjà utilisées dans ces laboratoires, rendre les technologies compatibles, et pour former des chercheurs qui pourront utiliser la puce dans différentes thématiques. Le prototype déjà disponible a été peu valorisé jusq
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
CEP - vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - další vedlejší obor
EH - Ekologie – společenstva
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Validace microarraye specifického pro aktinomycety byla provedena 29 kulturami aktinomycet a 17 kulturami jiných bakterií. Porovnání signálů, mismatchů a Gibbsovy energie prokázalo vysokou citlivost, protože pouze 1,3 % signálů bylo nespecifických.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2008
Ukončení řešení
31. 12. 2008
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
7. 8. 2008
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP09-MSM-ME-U/02:2
Datum dodání záznamu
7. 5. 2010
Finance
Celkové uznané náklady
50 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
50 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč