Využití necílené metabolomiky a proteomiky pro identifikaci nových biomarkerů pro sledování progrese mitochondriálních onemocnění

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202200001

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU22-01-00499

Název projektu anglicky

Identification of novel biomarkers for evaluation of mitochondrial disease progression by untargeted metabolomics and proteomics

Anotace anglicky

Mitochondria are indispensable for provision of cellular ATP and intermediates of biosynthetic pathways. Human disorders of oxidative phosphorylation (OXPHOS) cause severe mitochondrial diseases that mostly affect tissues with high energy demands. Cells with defective OXPHOS need to adapt multiple biochemical pathways in order to preserve metabolic homeostasis. Metabolic rewiring in affected tissues is subsequently reflected in changed levels of circulating metabolite, both low-molecular and protein ones. Association of numerous markers with mitochondrial diseases, such as lactate or amino acids, is well established. However, current progress in techniques of untargeted metabolomics or proteomics opens door for identification of novel biomarkers, which may indicate changes in disease progress or even the response to therapy. Within long-term collaboration between the Laboratory of Bioenergetics IPHYS CAS and the Department of Pediatrics and Inherited Metabolic Disorders of General University Hospital (KPDPM) we propose a project aiming to identify metabolic markers in plasma and urine of patients with mitochondrial diseases. We plan to study two large patient cohorts with long-term record at KPDPM – group with single long-scale mtDNA deletion (Kearns-Sayre syndrome, Pearson’s syndrome), group with mtDNA point mutation G3243>A (MELAS), and heterogenous group of patients with rare defects of nuclear origin. Plasma and urine samples will be collected at KPDPM, the levels of metabolites and proteins will be analyzed by established methods of untargeted metabolomics and proteomics at IPHYS and quantified in comparison to samples from control subjects. Obtained data will be correlated with current health status of patients regularly examined at KPDP. Newly identified markers will be validated in cellular models that are already available or will be tailormade to represent the type of mitochondrial disorder of patients within the study.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

Zahájení řešení

1. 5. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

19. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-MZ0-NU-R

Datum dodání záznamu

21. 11. 2023

Celkové uznané náklady

10 879 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 879 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč