Mechanismy vzniku a šíření glykopeptidové rezistence u Staphylococcus haemolyticus
Cíle projektu
Staphylococcus haemolyticus je jedním z nejvíce rezistentních původců nozokomiálních infekcí. Glykopeptidy (GP) patří mezi několik málo tříd antibiotik, které mají stále ještě relativně přijatelnou účinnost proti multi-rezistentním kmenům S. haemolyticus. Nicméně, jednoduchost s jakou se selektují GP-rezistentní kmeny je alarmující. Abychom v budoucnosti zabránili náhlému poklesu účinnosti glykopeptidů proti S. haemolyticus je nutné dobře porozumět mechanismům a rizikům vzniku a šíření GP rezistentních kmenů tohoto druhu. Kombinací tradičních přístupů klinické mikrobiologie s nejmodernějšími metodami celogenomových analýz (i) identifikujeme genetické změny vedoucí ke GP rezistenci; (ii) popíšeme epidemiologii GP-rezistentních kmenů S. haemolyticus v nemocničním prostředí; a (iii) určíme rizikové faktory pro rozvoj GP rezistence. Získané poznatky budou využity pro optimalizaci doporučených opatření v rámci národní antibiotické politiky.
Klíčová slova
antibiotická rezistenceglykopeptidová antibiotikavankomycinteikoplaninkoaguláza-negativní stafylokokyStaphylococcus haemolyticusrezistence ke glykopeptidůmmechanismus rezistencesekvenace nové generaceepidemiologieantibiotic resistanceglycopeptidesvancomycinteicoplanincoagulase-negative staphylococciStaphylococcus haemolyticusglycopeptide resistanceresistance mechanismnext generation sequencingepidemiology
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-28807A
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Mechanisms of emergence and spread of glycopeptide resistance in Staphylococcus haemolyticus
Anotace anglicky
Staphylococcus haemolyticus is one of the most multidrug-resistant species associated with nosocomial infections. Glycopeptides (GP) are among few antibiotic classes which retain relatively acceptable activity against multidrug-resistant S. haemolyticus strains. Nevertheless, the easy selection of GP-resistance in S. haemolyticus is alarming. In order to prevent a decline of glycopeptide activity against S. haemolyticus in the future, it is necessary to understand well the mechanisms and risks of emergence and spread of GP-resistant strains of this species. We will combine classical approaches of clinical microbiology with state-of-art genome-wide analysis to (i) identify genetic changes leading to glycopeptide-resistance; (ii) to describe epidemiology of GP-resistant S. haemolyticus strains in hospital environment and (iii) to determine risk factors for the development of GP resistance. Acquired knowledge will be used for the optimization of national antibiotic policy guidelines.
Vědní obory
Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10606 - Microbiology
10607 - Virology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt naplnil cíle, které byly stanoveny. V průběhu projektu byl studován vznik rezistence ke glykopeptidům u koaguláza negativních stafylokoků. Byly popsány specifické mutace vedoucí k selekci rezistence, navíc byla zjištěna jejich druhová a klonální specifita. U druhů S. haemolyticus byl in vitro zjištěn rychlejší vznik rezistence, který patrně souvisí s vlastním mechanismem vzniku rezistence (vyšší počet inzerčních sekvencí), rovněž u druhu S. epidermidis, který in vitro vykazoval sníženou schopnost vzniku rezistence, byla prokázána genetická predispozice pro vznik rezistence u specifického klonu (ST5), u kterého docházelo ke vzniku rezistence s vyšší frekvencí. Byl popsán vliv neglykopeptidových antibiotik na vznik a selekci rezistence - rifampicin přispíval ke vzniku rezistence k teikoplaninu, zatímco u imipenemu se tento efekt neprokázal. Získané výsledky jsou originální, řešitelka spolupracovala se zahraničním pracovištěm. Výsledky projektu byly publikované v časopisech s IF (
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 5. 2015
Ukončení řešení
31. 12. 2018
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
28. 6. 2018
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP19-MZ0-NV-U/02:1
Datum dodání záznamu
16. 9. 2019
Finance
Celkové uznané náklady
7 182 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 746 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
436 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
7 182 tis. Kč
Statní podpora
6 746 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
CEP
EE - Mikrobiologie, virologie
Doba řešení
01. 05. 2015 - 31. 12. 2018