Molekulární příčiny a mechanismy dědičných intrahepatálních cholestáz

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 4 (SMZ0201800001)
Hlavní účastníci
Institut klinické a experimentální medicíny
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV18-06-00032

Název projektu anglicky
Molecular basis and mechanisms of familial intrahepatic cholestasis
Anotace anglicky
Between 2002- 2017 we analyzed gDNA of 123 unrelated index patiens with suspect progressive or recurrent intrahepatic cholestasis (PFIC or BRIC). Mutation analysis of ATP8B1, ABCB11, ABCB4 and TJP2 was run in 82 patiens with low GGT cholestasis, ABCB4 was sequenced in 41 patients with high GGT cholestasis. The diagnosis of PFIC1, PFIC2, BRIC, PFIC3 and mild forms of MDR3 deficiency were confirmed in 1, 14, 10, 5 and 8 patients, respectively. The diagnosis was established in 38 (30.8%) index patients. The diagnosis remains unclear in 85 (69.2%) patients. Our goal is to find molecular basis and mechanism of the disease in most (or at least some) of these 85 patients and in several patients expected to come in 2018-2021. To achieve this, we plan to perform whole exome sequencing and, when appropriate, genome sequencing, copy number analysis or RNAseq, in most of these patients and their family members. Expression of mutated proteins will be detected on immunohistology. Pathogenicity of novel mutations will be tested in transfected cultured cells. For expected results see Aims.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30218 - General and internal medicine
OECD FORD - vedlejší obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie<br>FE - Ostatní obory vnitřního lékařství

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zaměřil na objasnění molekulární příčiny dědičně podmíněné intrahepatální cholestázy metodami molekulárně genetické analýzy (sekvenování exomu). Metodou sekvenovámí exomu bylo celkem vyšetřeno 59 nepříbuzných rodin. Dále byly cíleně vyšetřeny vybrané geny další metodou, Sangerovým sekvenováním. Řešení projektu bylo prodlouženo o jeden rok z technických, řádně zdůvodněných příčin, celkový potřebný počet vzorků byl splněn – anotováno bylo 80-100 vzorků, vyšetřeno bylo 127 vzorků. Projekt provázelo některých technických komplikací spojených s nedostupností přístroje (viz v popisu v závěrečné zprávě) Detailní popis výsledků je uveden ve zprávě. Výsledky byly publikovány ve formě originálních prací v renomovaných časopisech s IF.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
22. 6. 2023

Podobné projekty(10)