Nové přístupy k neinvazivní diagnostice mitochondriálních onemocnění
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-07-00149
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
New approaches to non-invasive diagnostics of mitochondrial diseases
Anotace anglicky
Mitochondrial diseases are caused by insufficient function of energy provision apparatus and they belong among the most severe inborn errors of metabolism. Whole exome sequencing helped to characterise many causal mutations, but as of yet, almost 40% of cases remain without defined genetic cause. Thorough non-invasive biochemical characterisation remains the centrepiece for successful interpretation of identified genetic variants. Aim of the project is to develop and optimise cryopreservation technique for blood elements, which will be compatible with subsequent functional analyses of mitochondrial function. Subsequently, they will be analysed through high resolution respirometry in permeabilised cells and by the analysis of preferred metabolic pathways in intact cells. In patients with biochemically verified mitochondrial dysfunction, causal genetic variant will be identified by exome sequencing and newly characterised variants will be functionally validated.
Vědní obory
Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30209 - Paediatrics
OECD FORD - vedlejší obor
30101 - Human genetics
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie<br>FG - Pediatrie
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu se podařilo zavést metodiku izolace, kryoprezervace a respirometrické evaluace mitochondriální funkce v PBMC buňkách (periferní mononukleární buňky) získaných od pacientů s potvrzeným nebo suspektním defektem mitochondriálního metabolizmu. Byly definovány konkrétní parametry získané během respirometrické analýzy, které mohou sloužit jako prediktivní markery pro defekty komplexu I (nízká porce cI dependentní spřažené respirace), mutace v SURF1 (UCR hodnoty nad 1) a defekty ATP syntázy (UCR hodnoty nad 1,2). Za dobu trvání projektu bylo NGS sekvenováno celkem 31 pacientů s mitochondriálním onemocněním a genetická příčina byla odhalena v celkem 16 případech. Dále jsme detailně analyzovali patofyziologické mechanizmy asociované s mutacemi v UQCRC2, POLRMT, AIFM1 a MECR genech, kódujících mitochondriální proteiny. Práce přinesla kvalitní publikační výstupy a přispěla k objasnění genetické příčiny u řady pacientů s mitochondriálním onemocněním.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 5. 2019
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
19. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
22. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
14 521 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
14 521 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč