Celogenomové sekvenování pro nemocniční epidemiologii a detekci outbreaků způsobených multirezistentními bakteriemi

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Fakultní nemocnice Brno
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-09-00430

Název projektu anglicky
Whole-Genome Sequencing for Hospital Epidemiology and Multi-drug Resistant Bacteria Outbreaks Detection
Anotace anglicky
Healthcare associated infections (HAI) caused by multidrug-resistant bacteria are a frequent complication of hospitalization. It results in worsening patients' quality of life, prolonged hospitalization and a significant increase in treatment costs. The most important hospital pathogens include enterobacteria with the production of broad-spectrum betalactamases and carbapenemases, methicil-resistant Staphylococcus aureus and vancomycin-resistant Enterococcus faecium. Knowing the ways in which these dangerous pathogens are spread within hospital facilities is key to implementing effective anti-epidemic measures. Molecular typing methods are able to distinguish bacterial strains within one species and thus form the basis for epidemiological studies. The most discriminative method is currently whole-gene sequencing. In conjunction with appropriate bioinformatics tools, it provides information not only about the relatedness of bacterial strains isolated in hospitals, but also about the genetic content of each strain and its pathogenic potential.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
1/ Projekt se zabýval závažným problémem molekulární typizace multirezistentních baktérií v nemocničním prostředí. Autorům se podařilo cíle naplnit publikováním metodik pro subtypizaci baktérií pomocí moderních přístupů. 2/ Všechny publikované práce popisují výsledky originálního výzkumu, jsou metodicky velmi cenné, a vztahují se přímo k hlavním cílům projektu. Publikace rovněž obsahuji výhradní dedikaci tomuto projektu z hlediska AZV. 3/ Výsledky tohoto projektu mají význam především pro pracovníky v mikrobiologických laboratořích a pro lékaře na odděleních s rizikem vzniku multirezistentní infekce. Projekt má velký přesah do preventivní medicíny. Přímý dopad do praxe mají především vytvořené metodiky. 4/ Výstupy projektu byly publikovány v 5 Jimp časopisech (3xQ1 a 2xQ2) se souhrnným IF 33,5 na základě hodnocení WoS v roce 2021. Výsledky jsou adekvátní původním cílům kvalitativně i kvantitativně. 5/ Nedostatky v dodržování Zadávací dokumentace či v čerpání rozpočtu nebyly shledány.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
22. 6. 2023

Podobné projekty(10)