Evaluation of Reference Genes for the Relative Quantification of Apple stem groowing virus and Apple mosaic virus in Apple Trees
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F12%3A00002142" target="_blank" >RIV/00027006:_____/12:00002142 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s13337-012-0065-4" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s13337-012-0065-4</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s13337-012-0065-4" target="_blank" >10.1007/s13337-012-0065-4</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evaluation of Reference Genes for the Relative Quantification of Apple stem groowing virus and Apple mosaic virus in Apple Trees
Popis výsledku v původním jazyce
A SYBR Green-based one step RT-qPCR assay was developed for the detection and quantification of Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple mosaic virus(ApMV). The RT-qPCR assay employed seven plant expressed genes?glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH), 18S ribosomal RNA, ubiquitin, ribosomal protein S19, Rubisco, RNA polymerase subunit II and b-actin?as internal reference housekeeping genes in a relative quantification system in three apple cultivars. The average expression stability (M) found by GeNorm software suggest that GAPDH and S19 were the most stable reference genes. We propose employing GAPDH and S19 as housekeeping genes for accurate quantification of ASGV and ApMV in apple leaf samples. The detection limit for both viruses was found around 70 copies of viral genome by one-step RT-qPCR.
Název v anglickém jazyce
Evaluation of Reference Genes for the Relative Quantification of Apple stem groowing virus and Apple mosaic virus in Apple Trees
Popis výsledku anglicky
A SYBR Green-based one step RT-qPCR assay was developed for the detection and quantification of Apple stem grooving virus (ASGV) and Apple mosaic virus(ApMV). The RT-qPCR assay employed seven plant expressed genes?glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH), 18S ribosomal RNA, ubiquitin, ribosomal protein S19, Rubisco, RNA polymerase subunit II and b-actin?as internal reference housekeeping genes in a relative quantification system in three apple cultivars. The average expression stability (M) found by GeNorm software suggest that GAPDH and S19 were the most stable reference genes. We propose employing GAPDH and S19 as housekeeping genes for accurate quantification of ASGV and ApMV in apple leaf samples. The detection limit for both viruses was found around 70 copies of viral genome by one-step RT-qPCR.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Indian Journal of Virology
ISSN
0970-2822
e-ISSN
—
Svazek periodika
23
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
IN - Indická republika
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
39-41
Kód UT WoS článku
000304157400007
EID výsledku v databázi Scopus
—