Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

International interlaboratory study on TaqMan real-time polymerase chain reaction authentication of black seabream (Spondyliosoma cantharus)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027022%3A_____%2F18%3AN0000008" target="_blank" >RIV/00027022:_____/18:N0000008 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11310/18:10390775 RIV/60461373:22330/18:43917524 RIV/75010330:_____/18:00012196

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.vup.sk/en/index.php?mainID=2&navID=34&version=2&volume=57&article=2084" target="_blank" >http://www.vup.sk/en/index.php?mainID=2&navID=34&version=2&volume=57&article=2084</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    International interlaboratory study on TaqMan real-time polymerase chain reaction authentication of black seabream (Spondyliosoma cantharus)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    An interlaboratory study of five laboratories testing real-time polymerase chain reaction (PCR) with TaqMan probe detection of black seabream (Spondyliosoma cantharus) fish is presented in this work. The method is oriented to the intron of the nuclear gene encoding the main protein of the musculature of the fish, parvalbumin. This feature distinguishes the employed approach from those based on mitochondrial genes. Here, the intron is flanked by exon stretches highly conserved among species. This provides a unique advantage when a new fish species emerges as a commodity on the market: Species-versatile degenerate primers can be easily designed on these conserved exon stretches. Therefore, the initial uncertainty of the species-specific sequence of the intron can, in such case, be bypassed during the adoption of the method to this particular new species, because the amplicon obtained at this pilot stage provides the sequence of the intron itself. DNA isolates from eight exemplars of S. cantharus and from nineteen other fish species, the latter being used as negative controls, were tested in this study by participating laboratories. The readouts in qualitative assessment were 100% accurate. The quantitative results provided an average value and variation among samples representing particular exemplars of S. cantharus.

  • Název v anglickém jazyce

    International interlaboratory study on TaqMan real-time polymerase chain reaction authentication of black seabream (Spondyliosoma cantharus)

  • Popis výsledku anglicky

    An interlaboratory study of five laboratories testing real-time polymerase chain reaction (PCR) with TaqMan probe detection of black seabream (Spondyliosoma cantharus) fish is presented in this work. The method is oriented to the intron of the nuclear gene encoding the main protein of the musculature of the fish, parvalbumin. This feature distinguishes the employed approach from those based on mitochondrial genes. Here, the intron is flanked by exon stretches highly conserved among species. This provides a unique advantage when a new fish species emerges as a commodity on the market: Species-versatile degenerate primers can be easily designed on these conserved exon stretches. Therefore, the initial uncertainty of the species-specific sequence of the intron can, in such case, be bypassed during the adoption of the method to this particular new species, because the amplicon obtained at this pilot stage provides the sequence of the intron itself. DNA isolates from eight exemplars of S. cantharus and from nineteen other fish species, the latter being used as negative controls, were tested in this study by participating laboratories. The readouts in qualitative assessment were 100% accurate. The quantitative results provided an average value and variation among samples representing particular exemplars of S. cantharus.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40103 - Fishery

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Food and Nutrition Research

  • ISSN

    1336-8672

  • e-ISSN

    1338-4260

  • Svazek periodika

    57

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    SK - Slovenská republika

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    27-37

  • Kód UT WoS článku

    000430630000003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85044600650