Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F17%3AN0000158" target="_blank" >RIV/00027162:_____/17:N0000158 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat

Popis výsledku v původním jazyce

Výsledek je diagnostický set pro laboratorní in vitro stanovení citlivosti/rezistence klinických izolátů bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat na základě stanovení minimálních inhibičních koncentrací (MIC) mikrodiluční metodou ke 12 antibiotikům (ampicilin, penicilin, ceftiofur, vankomycin, klindamycin, meropenem, tigecyklin, enrofloxacin, tiamulin, tysosin, florfenikol a kombinace trimethoprimu a sulfamethoxazolu). Jedná se o mikrotitrační destičku s 96 jamkami - 12 sloupců (1-12) a 8 řádků (A-H). Ve sloupcích je v růstovém médiu naředěno dvanáct antibiotik používaných k léčbě infekcí zvířat způsobených anaerobními bakteriemi v objemu 200 µl, u jedenácti antibiotik (sloupce 1-11) je na destičce 8 ředění (řádky A-H) a u jednoho antibiotika (sloupec 12) je 7 ředění (řádky B-H) a v řádku A je jamka s 200 µl média bez antibiotika sloužící jako pozitivní kontrola růstu testovaných bakterií. Počáteční koncentrace jednotlivých antibiotik na destičce jsou rozdílné a jsou voleny tak, aby hodnoty MIC vyšetřovaných bakterií zahrnovaly rozmezí breakpointů citlivosti/rezistence podle závazných mezinárodních metodik Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) a European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) rozmezí hodnot MIC bakteriálních kmenů povinně testovaných v rámci kontroly kvality, které je pro jednotlivá antibiotika rozdílné. Pro anaerobní bakterie je použito růstové médium Brucella Broth obohacené heminem a vitamínem K1 (CLSI, EUCAST). Součástí funkčního vzorku je i doporučená interpretace výsledků stanovení MIC pomocí tzv. klinických breakpointů antimikrobiálních látek (EUCAST, CLSI). Vyšetřovaný kmen bakterie lze kategorizovat za předpokladu, že příslušné breakpointy jsou použity v definovaném fenotypovém systému, to znamená, že uvedené breakpointy platí pouze pro anaerobní bakterie. Breakpointy rozdělují izoláty na citlivé, intermediální a rezistentní na základě zjištěné hodnoty MIC, tzn., že je definováno pro každé antibiotikum zvlášť (breakpointy se liší) rozmezí hodnot MIC pro citlivé, intermediální a rezistentní kmeny. Funkčnost setu byla ověřena testováním kontrolního kmene Clostridium difficile ATCC 700057, který je přesně definován a povolené rozmezí zjišťovaných hodnot MIC k antibiotikům obsaženým v setu jsou uvedeny v laboratorních standardech CLSI a EUCAST. Stanovené hodnoty MIC jednotlivých antibiotik musí být v rozmezí definovaných hodnot MIC referenčních kmenů dle CLSI a EUCAST. Metody vyšetření citlivosti/rezistence anaerobních patogenů k antibiotikům a také interpretace zjištěných výsledků nejsou v současné době jednotné a neposkytují proto v některých případech relevantní výsledky pro klinickou veterinární praxi. Využitím funkčního vzorku je možné provádět komplexní vyšetřování nebo monitoring rezistence/citlivosti bakteriálních anaerobních patogenů zvířat s významem pro humánní i veterinární oblast. Realizací těchto metod bude dosažena potřebná úroveň výsledků ke sledování a vyhodnocení šíření rezistencí k antimikrobiálním látkám v bakteriálních populacích.

Název v anglickém jazyce

The set for defermination of minimal inhibitory concentrations of antimicrobals in anaerobe bacterial pathogens of livestock animals

Popis výsledku anglicky

The result is a diagnostic kit for laboratory in vitro determination of the susceptibility / resistance of clinical isolates of bacterial anaerobic pathogens of farm animals based on the determination of minimum inhibitory concentrations (MIC) by the microdilution method to 12 antibiotics (ampicillin, penicillin, ceftiofur, vancomycin, clindamycin, meropenem, tigecycline, enrofloxacin, tiamulin, tylosin, florfenicol and combinations of trimethoprim and sulfamethoxazole). It is a 96-well microtiter plate - 12 columns (1-12) and 8 rows (A-H). Twelve antibiotics used for the treatment of animal infections caused by anaerobic bacteria in a volume of 200 μl are diluted in the growth medium, eleven antibiotics (columns 1-11) are diluted on plate 8 (lines AH) and one antibiotic (column 12) is 7 dilutions (BH lines) and line A is a well with 200 μl antibiotic-free media serving as a positive control of the growth of the test bacteria. Initial concentrations of individual antibiotics on the plate are different and are chosen so that the MIC values of the investigated bacteria include a range of sensitivity / resistance breakpoints according to the binding international methodologies of the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) and the European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) range of MIC values of bacterial strains which are compulsorily tested for quality control, which is different for each antibiotic. For anaerobic bacteria, Brucella Broth growth medium enriched with hemin and vitamin K1 (CLSI, EUCAST) is used. Part of the functional sample is also the recommended interpretation of MIC assay results using so-called clinical breakpoints of antimicrobial agents (EUCAST, CLSI). The bacteria strain being investigated can be categorized provided that the relevant breakpoints are used in a defined phenotypic system, that is, that the breakpoints are valid only for anaerobic bacteria. The breakpoints divide the isolates into sensitive, intermediate and resistant based on the MIC, that is, the range of MIC values for sensitive, intermediate and resistant strains is defined separately for each antibiotic (breakpoints). The functionality of the kit was verified by testing the Clostridium difficile control strain ATCC 700057, which is precisely defined, and the allowed range of MIC detection values for the antibiotics contained in the set are given in the CLSI and EUCAST laboratory standards. The MIC values of each antibiotic must be within the defined CLSI and EUCAST defined MIC reference ranges. The methods of sensitivity / resistance assessment of anaerobic pathogens to antibiotics, as well as the interpretation of the results obtained, are currently not uniform and therefore do not provide, in some cases, relevant results for clinical veterinary practice. By using a functional sample, it is possible to perform a comprehensive investigation or monitoring of the resistance / susceptibility of bacterial anaerobic pathogens of animals of importance to the human and veterinary field. By implementing these methods, the required level of results will be achieved to monitor and evaluate the spread of antimicrobial resistance in bacterial populations.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

FV- Set na stanovení MIC - anaerobní bakterie

Číselná identifikace

—

Technické parametry

Výsledek vznikl v rámci grantu TAČR GAMA a v souladu se zadávací dokumentací projektu bude komercializován v následujícím období po ukončení řešení.

Ekonomické parametry

Ekonomické přínosy využívání výsledku lze rozdělit minimálně na dvě oblasti – zisk diagnostických laboratoří prováděním stanovení citlivosti/rezistence anaerobních bakterií k antibiotikům a ekonomický přínos pro chovatele hospodářských zvířat. Ekonomický přínos pro laboratoře bude představovat zisk z provedených vyšetření. Za předpokladu vyšetření v jedné laboratoři cca 500 vzorků ročně při ceně za jedno vyšetření kolem 500,- Kč, by se zisk 20 % z tržeb mohl pohybovat kolem 50 tis. pro jednu laboratoř. Dalším uživatelům výsledků vyšetření - chovatelům hospodářských zvířat se sníží zlepšením diagnostiky ekonomické náklady na léčbu a prevenci onemocnění a zvýší se tržby za prodej zdravotně nezávadných kvalitních potravin a surovin živočišného původu. Přesné vyčíslení přínosů chovatelům není možné, záleží vždy na zdravotní situaci a způsobu managementu v jednotlivých chovech.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00027162

Název vlastníka

Výzkumný ústav veterinárního lékařství Brno, v.v.i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)

Požadavek na licenční poplatek

—

Adresa www stránky s výsledkem

https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf