Optimalizace MOL-PCR pro multiplexní detekci patogenů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F18%3AN0000069" target="_blank" >RIV/00027162:_____/18:N0000069 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/18:00102319

Výsledek na webu

<a href="http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2018.pdf" target="_blank" >http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2018.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Optimalizace MOL-PCR pro multiplexní detekci patogenů

Popis výsledku v původním jazyce

Konference RANK (Rutinní analýza nukleových kyselin). Soudobé možnosti na poli diagnostických a skríningových metod i nadále zaznamenávají výrazné pokroky, avšak stále není k dispozici dostatečně komplexní a multiplexní aplikace, umožňující sjednocení stávajících postupů v jednoduchý a funkční celek. Naše práce je v tomto směru zaměřena na vývoj metodiky s potenciálem pro rychlý a simultánní skríning širšího spektra patogenů ve směsném vzorku. Kvalitativní analýza je založená na multiplexní oligonukleotidové ligaci-PCR (MOL-PCR) s adaptací na suspenzní detekční systém xMAP, využívajícího magnetických mikrosfér. Optimalizací reakčních podmínek jsme vytvořili ucelený protokol pro rychlou detekci medicínsky a klinicky významných virů, bakterií a parazitů, kontaminujících zejména potravinové zdroje. Jednotlivé systémy jsou v současné době testovány se zaměřením na funkčnost v multiplexu, přičemž cílem našich snah je vytvořit detekční panely uzpůsobené různým typům vstupních matric, jako např. zelenina/ovoce, maso, voda, stolice.

Název v anglickém jazyce

Optimization of MOL-PCR for multiplex detection of pathogens

Popis výsledku anglicky

Conference on Routine analysis of nucleic acids. Current possibilities in the field of diagnostic and screening methods continue to show significant advances, however, complex and multiplex applications are still lacking. Our research is focused on development of a methodology with the potential for rapid and simultaneous screening of a wider spectrum of pathogens in a mixed sample. The qualitative analysis is based on multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR), adapted to the xMAP suspense detection system using magnetic microspheres. By optimizing the reaction conditions, we have developed a comprehensive protocol for the rapid detection of medically and clinically significant viruses, bacteria and parasites, contaminating food sources in particular. Individual systems are currently being tested with a focus on multiplex functionality. Our goal is to create detection panels adapted to different types of input matrices, such as vegetables/fruits, meat, water, and stools.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů