Real-time PCR v detekci potenciálně patogenních mikrořas rodu Prototheca

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000104" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000104 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Real-time PCR v detekci potenciálně patogenních mikrořas rodu Prototheca

Popis výsledku v původním jazyce

VII. ročník Kongresu klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie (KMINE), pořádaný Českou lékařskou společností ČLS JEP. Olomouc 14.11.-16.11.2019 – poster. Cíl studie: Lidská či zvířecí prototékóza patří spíše mezi vzácné endemické prozánětlivé infekce. Je způsobena achlorofylními mikrořasami rodu Prototheca. Konkrétně P. wickerhamii může kolonizovat kůži pacientů, ale v závažnějších případech napadá i respirační či trávicí trakt. P. zopfii genotyp 2 je často skloňovaná jako nebakteriální původce mastitid dojného skotu. Na rozdíl od bakteriálních infekcí zde léčba antibiotiky neúčinkuje a následuje zbytečné nadužívání antibiotických preparátů, doprovázené ekonomickými ztrátami pro chovatele. Cílem studie bylo vyvinout efektivní systém pro včasnou diagnostiku této zoonózy. Metody: Byly vytvořeny dva unikátní multiplexní real-time PCR systémy s TaqMan sondami, amplifikující úseky genů acetyl CoA reduktázy a velké ribozomální podjednotky, specifické pro jednotlivá Prototheca spp. Tato rychlá a citlivá metoda umožňuje detekci prototékózy v různých matricích, zejména v mléce, prostředí ale i v krvi či tkáních. Výsledky: Byl vytvořen systém dvou multiplexních qPCR s IAC, které umožňují určit nejen zda se ve vzorku Prototheca ssp. vyskytují, ale také přímo detekovat a kvantifikovat patogenní P. zopfii genotyp 2, P. wickerhamii, P. blaschkeae, či nepatogenní P. zopfii genotyp 1. Specifita byla testována na panelu prototék a kvasinek. Závěry: Rychlá detekce a kvantifikace prototékózy může vést k zahájení opatření, snižující výskyt a šíření tohoto potencionálního patogenu v chovech dojného skotu, a tak omezit ztráty na kvalitě a kvantitě mléčné produkce a případné riziko přenosu této infekce na člověka.

Název v anglickém jazyce

Real-time PCR in detection of potentially pathogenic microalgae of the genus Prototheca

Popis výsledku anglicky

Objective: Human or animal protothecosis is a rare endemic pro-inflammatory infection. It is caused by achlorophyllic algae of the genus Prototheca. Specifically, P. wickerhamii can colonize the skin of patients, but in more severe cases it also attacks the respiratory or gastrointestinal tract. P. zopfii genotype 2 is often referred to as a non-bacterial agent of dairy cattle mastitis. Unlike from bacterial infections, antibiotic treatment is not effective here, followed by unnecessary overuse of antibiotic products, accompanied by economic losses for farmers. The aim of the study was to develop an effective system for early diagnosis of this zoonosis. Methods: Two unique multiplex real-time PCR systems with TaqMan probes were created, amplifying regions of acetyl CoA reductase genes and large ribosomal subunits, specific for individual Prototheca spp. This rapid and sensitive method allows the detection of protothecosis in various matrices, especially in milk, the environment, but also in blood or tissues. Results: A system of two multiplex qPCRs with IAC was created, which allows not only to determine whether they occur in the Prototheca ssp. sample, but also directly detect and quantify the pathogenic P. zopfii genotype 2, P. wickerhamii, P. blaschkeae, or non-pathogenic P. zopfii genotype 1. Conclusions: Rapid detection and quantification of protothecosis may lead to initiation of measures reducing incidence and spreading this potential pathogen in dairy cattle farms, thus reducing quality losses and the quantity of milk production and the potential risk of transmission of this infection to humans.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910092" target="_blank" >QK1910092: Nebakteriální původci mastitid a jejich vliv na kvalitu a technologické vlastnosti mléka</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů