Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

A novel TaqMan qPCR assay for rapid detection and quantification of pro-inflammatory microalgae Prototheca spp. in milk samples

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000105" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000105 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/26722861:_____/21:N0000026 RIV/62157124:16270/21:43879164

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/mmy/article-abstract/59/8/784/6123940?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/mmy/article-abstract/59/8/784/6123940?redirectedFrom=fulltext</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/mmy/myaa120" target="_blank" >10.1093/mmy/myaa120</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    A novel TaqMan qPCR assay for rapid detection and quantification of pro-inflammatory microalgae Prototheca spp. in milk samples

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Animal or human protothecosis belong to rather rare, endemic, pro-inflammatory infections. It is caused by achlorophyllous algae of the genus Prototheca. Especially P. bovis (formerly P. zopfii genotype 2) is often inflected as a non-bacterial causative agent of dairy cattle mastitis. In this study, we present a multiplex real-time PCR (qPCR) system for rapid and exact Prototheca spp. detection and quantification. Limit of detection, diagnostic sensitivity and specificity were determined. For the first time, specific sequences of AccD (encoding acetyl CoA reductase) for P. bovis, cox1 (encoding cytochrome C oxidase subunit 1) for P. wickerhamii, cytB (encoding cytochrome B) for P. blashkeae and atp6 (encoding transporting ATPase F0 subunit 6) for P. ciferrii (formerly P. zopfii genotype 1) were used for species identification and quantification together with 28S rRNA sequence detecting genus Prototheca. The developed qPCR assay was applied to 55 individual cow milk samples from a herd suspected of protothecosis, 41 bulk milk samples from different Czech farms, 16 boxed milk samples purchased in supermarkets and 21 environmental samples originating from a farm suspected of protothecosis. Our work thus offers the possibility to distinguish protothecosis from more common bacterial mastitis in dairy herds and thereby assisting whether use of antibiotics is necessary.

  • Název v anglickém jazyce

    A novel TaqMan qPCR assay for rapid detection and quantification of pro-inflammatory microalgae Prototheca spp. in milk samples

  • Popis výsledku anglicky

    Animal or human protothecosis belong to rather rare, endemic, pro-inflammatory infections. It is caused by achlorophyllous algae of the genus Prototheca. Especially P. bovis (formerly P. zopfii genotype 2) is often inflected as a non-bacterial causative agent of dairy cattle mastitis. In this study, we present a multiplex real-time PCR (qPCR) system for rapid and exact Prototheca spp. detection and quantification. Limit of detection, diagnostic sensitivity and specificity were determined. For the first time, specific sequences of AccD (encoding acetyl CoA reductase) for P. bovis, cox1 (encoding cytochrome C oxidase subunit 1) for P. wickerhamii, cytB (encoding cytochrome B) for P. blashkeae and atp6 (encoding transporting ATPase F0 subunit 6) for P. ciferrii (formerly P. zopfii genotype 1) were used for species identification and quantification together with 28S rRNA sequence detecting genus Prototheca. The developed qPCR assay was applied to 55 individual cow milk samples from a herd suspected of protothecosis, 41 bulk milk samples from different Czech farms, 16 boxed milk samples purchased in supermarkets and 21 environmental samples originating from a farm suspected of protothecosis. Our work thus offers the possibility to distinguish protothecosis from more common bacterial mastitis in dairy herds and thereby assisting whether use of antibiotics is necessary.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/QK1910092" target="_blank" >QK1910092: Nebakteriální původci mastitid a jejich vliv na kvalitu a technologické vlastnosti mléka</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Medical Mycology

  • ISSN

    1369-3786

  • e-ISSN

    1460-2709

  • Svazek periodika

    59

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    784–792

  • Kód UT WoS článku

    000687223600004

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85113771641