Metoda izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000117" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000117 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metoda izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků

Popis výsledku v původním jazyce

Pro průkaz viru afrického moru prasat v mase a masných výrobcích je nutná jeho spolehlivá detekce. Molekulární detekce pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR) představuje citlivou metodu, s možností kvantifikace virové nálože ve vzorku. Pro tento účel je důležité získat nukleovou kyselinu odpovídající koncentrace a čistoty. Představovaná metoda, kombinace fenol-chloroformové extrakce nukleové kyseliny a izolace s využitím magnetických mikročástic, poskytuje z komplexních matric masa a masných výrobků nukleovou kyselinu požadované čistoty. Následná detekce cílové sekvence vykazuje limit detekce 400 kopií DNA ve vzorku.

Název v anglickém jazyce

Method for isolation and detection of African Swine Fever Virus DNA from meat and meat products

Popis výsledku anglicky

A need for the detection of the African swine fever virus genome in meat and meat products requires its reliable detection in various matrices. Molecular detection via qPCR represents a sensitive method, with the possibility of the quantification of viral load in the sample. For this purpose, it is necessary to obtain a nucleic acid in the adequate concentration and purity. Presented method, a combination of phenol-chloroform extraction of nucleic acids followed with magnetic beads-based isolation of nucleic acid yields nucleic acids of the desired purity from meat and meat products matrices. The detection limit of subsequent qPCR is 400 copies of DNA in sample.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/QK1920113" target="_blank" >QK1920113: Virus afrického moru prasat v mase a masných výrobcích – metody detekce a studium perzistence</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

B0003

Číselná identifikace

Funkční vzorek 5704/2019

Technické parametry

Technické řešení „Metody izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků“ je založeno na kombinaci fenol-chloroformové extrakce DNA a izolace na magnetických kuličkách. Izolovaná DNA je detekována metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce v reálném čase (qPCR). Použití kombinace fenol-chloroformové extrakce nukleové kyseliny umožní zredukovat pracovní činnost v prostorách laboratoří bezpečnostního stupně 3 a koncová izolace s použitím komerční soupravy může být v budoucnu automatizována, čím se může zajistit zpracovávání většího množství vzorků, snížení pracnosti metody a její urychlení.

Ekonomické parametry

V současné době nelze ekonomické aspekty odhadnout Náklady na zavedení metodiky do laboratoře se týkají pořízení spotřebního materiálu, chemikálií, souprav pro izolaci nukleových kyselin, provedení qPCR a syntézu oligonukleotidů. Náklady na materiál na vyšetření jednoho vzorku (bez DPH) se pohybují kolem 680 Kč za vzorek, a to včetně použití standardů a kontrol.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00027162

Název vlastníka

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf