Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000298" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000298 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14310/19:00109199

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.nature.com/articles/s41598-019-40035-5" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-019-40035-5</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) is a rapid method for simultaneous detection of multiple molecular markers within a single reaction. MOL-PCR is increasingly employed in microbial detection assays, where its ability to facilitate identification and further characterization via simple analysis is of great benefit and significantly simplifies routine diagnostics. When adapted to microsphere suspension arrays on a MAGPIX reader, MOL-PCR has the potential to outperform standard nucleic acid-based diagnostic assays. This study represents the guideline towards in-house MOL-PCR assay optimization using the example of foodborne pathogens (bacteria and parasites) with an emphasis on the appropriate choice of crucial parameters. The optimized protocol focused on specific sequence detection utilizes the fluorescent reporter BODIPY-TMRX and self-coupled magnetic microspheres and allows for a smooth and brisk workflow which should serve as a guide for the development of MOL-PCR assays intended for pathogen detection.

  • Název v anglickém jazyce

    A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay

  • Popis výsledku anglicky

    Multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) is a rapid method for simultaneous detection of multiple molecular markers within a single reaction. MOL-PCR is increasingly employed in microbial detection assays, where its ability to facilitate identification and further characterization via simple analysis is of great benefit and significantly simplifies routine diagnostics. When adapted to microsphere suspension arrays on a MAGPIX reader, MOL-PCR has the potential to outperform standard nucleic acid-based diagnostic assays. This study represents the guideline towards in-house MOL-PCR assay optimization using the example of foodborne pathogens (bacteria and parasites) with an emphasis on the appropriate choice of crucial parameters. The optimized protocol focused on specific sequence detection utilizes the fluorescent reporter BODIPY-TMRX and self-coupled magnetic microspheres and allows for a smooth and brisk workflow which should serve as a guide for the development of MOL-PCR assays intended for pathogen detection.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    FEB 2019

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    2719

  • Kód UT WoS článku

    000459571100082

  • EID výsledku v databázi Scopus