A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000298" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000298 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14310/19:00109199
Výsledek na webu
<a href="https://www.nature.com/articles/s41598-019-40035-5" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-019-40035-5</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay
Popis výsledku v původním jazyce
Multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) is a rapid method for simultaneous detection of multiple molecular markers within a single reaction. MOL-PCR is increasingly employed in microbial detection assays, where its ability to facilitate identification and further characterization via simple analysis is of great benefit and significantly simplifies routine diagnostics. When adapted to microsphere suspension arrays on a MAGPIX reader, MOL-PCR has the potential to outperform standard nucleic acid-based diagnostic assays. This study represents the guideline towards in-house MOL-PCR assay optimization using the example of foodborne pathogens (bacteria and parasites) with an emphasis on the appropriate choice of crucial parameters. The optimized protocol focused on specific sequence detection utilizes the fluorescent reporter BODIPY-TMRX and self-coupled magnetic microspheres and allows for a smooth and brisk workflow which should serve as a guide for the development of MOL-PCR assays intended for pathogen detection.
Název v anglickém jazyce
A novel perspective on MOL-PCR optimization and MAGPIX analysis of in-house multiplex foodborne pathogens detection assay
Popis výsledku anglicky
Multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) is a rapid method for simultaneous detection of multiple molecular markers within a single reaction. MOL-PCR is increasingly employed in microbial detection assays, where its ability to facilitate identification and further characterization via simple analysis is of great benefit and significantly simplifies routine diagnostics. When adapted to microsphere suspension arrays on a MAGPIX reader, MOL-PCR has the potential to outperform standard nucleic acid-based diagnostic assays. This study represents the guideline towards in-house MOL-PCR assay optimization using the example of foodborne pathogens (bacteria and parasites) with an emphasis on the appropriate choice of crucial parameters. The optimized protocol focused on specific sequence detection utilizes the fluorescent reporter BODIPY-TMRX and self-coupled magnetic microspheres and allows for a smooth and brisk workflow which should serve as a guide for the development of MOL-PCR assays intended for pathogen detection.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Scientific Reports
ISSN
2045-2322
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
FEB 2019
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
2719
Kód UT WoS článku
000459571100082
EID výsledku v databázi Scopus
—