Výskyt genů rezistence a studium okolí těchto genů u izolátů L. amyovorus získaných z gastrointestinálního traktu domácích a volně žijících prasat

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F22%3AN0000104" target="_blank" >RIV/00027162:_____/22:N0000104 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://kongrescssm2022.bpp.cz/cs/odborny-program-108" target="_blank" >https://kongrescssm2022.bpp.cz/cs/odborny-program-108</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Výskyt genů rezistence a studium okolí těchto genů u izolátů L. amyovorus získaných z gastrointestinálního traktu domácích a volně žijících prasat

Popis výsledku v původním jazyce

Úvod: Rozvoj antibiotické rezistence v chovech prasat se stává alarmující problematikou. Hospodářským zvířatům jsou běžně podávána antibiotika při terapeutických úkonech. Právě zvířata, léčená antibiotiky, mohou být rezervoárem rezistentních bakterií pro volně žijící druhy zvířat. Cíl: Cílem této studie bylo zanalyzovat genomy testovaných izolátů L. amylovorus, odebraných z trávicího traktu domácích a divokých prasat, z hlediska výskytu genů rezistence a z hlediska šíření těchto genů. Metodika: Izoláty byly analyzovány pomocí fenotypových metod, ale také pomocí celogenomového sekvenování s využitím technologie Illumina. Pomocí specializovaných databází (ResFinder, CARD) a programů (MEGA-X, Artemis, MAUVE) byly vyhledávány geny rezistence a bylo studováno okolí těchto genů. Výsledky: Při rozboru sekvenčních dat byla zjištěna přítomnost zejména genů rezistence tetW a ermB. Přítomnost těchto genů byla prokázána u izolátů získaných z domácích prasat, které vykazovaly fenotypovou rezistenci k těmto antibiotikům. V okolí genu rezistence se vyskytovalo velké množství transposáz podmiňujících přenos daného úseku. Závěr: Bylo zjištěno, že izoláty pocházející z domácích prasat obsahují ve svém genomu geny rezistence. U divočáků bylo naopak zjištěno nízké procento rezistentních laktobacilů. Je však jen otázkou času, kdy se rezistentní bakterie dostanou i do gastrointestinálního traktu zvířat, která nejsou primárně exponována antibiotickému působení. "

Název v anglickém jazyce

Presence of resistant genes and analyzing of its surrounding in isolates of L. amylovorus obtained from gastrointestinal tract of domestic pigs and wild boars

Popis výsledku anglicky

Introduction: One of the most alarming hazard in the pig farms now is spreading of antimicrobial resistance there. Antibiotics are often given to farm animals during therapeutical procedures. Animals treated by antibiotics might be reservoirs of the resistant bacteria for wild-life animals. The aim of the study is analyzing of the genomes of tested L. amylovorus isolates, obtained from gastrointestinal tract of domestic pigs and wild boars, in terms of resistance genes presence and its spreading. Methods: Isolates have been analyzing by phenotypical methods as well as by molecular analyses using whole genome sequencing (Illumina). There were found genes of resistance and studied its surrounding by using specialized databases (ResFinder, CARD) and programs (MEGA-X, Artemis, MAUVE). Results: The analysis of sequencing data reveals presence of the tetW and ermB genes of resistance. Those genes have been found in the isolates obtained from domestic pigs, which have showed phenotypic resistance for these antibiotics. In the surrounding of resistant gene was presented amount of transposases, which cause transposition of the sequence. Conclusion: It has been found that isolates obtained from domestic pigs contain the resistant genes in their genome. In isolates obtained from wild boars have been found low percent of resistant isolates. However, it is matter of time when the resistant bacteria reach to gastrointestinal tract of the animals, which are not primarily exposed to antibiotics.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910351" target="_blank" >QK1910351: Divoká a domácí prasata jako zdroj probiotických kultur a vliv technologických postupů přípravy a skladby synbiotického krmiva na jeho efektivitu a funkčnost</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů