Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Survey of Genotype Diversity, Virulence, and Antimicrobial Resistance Genes in Mastitis-Causing Streptococcus uberis in Dairy Herds Using Whole-Genome Sequencing

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F23%3AN0000181" target="_blank" >RIV/00027162:_____/23:N0000181 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/2076-0817/12/12/1378" target="_blank" >https://www.mdpi.com/2076-0817/12/12/1378</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/pathogens12121378" target="_blank" >10.3390/pathogens12121378</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Survey of Genotype Diversity, Virulence, and Antimicrobial Resistance Genes in Mastitis-Causing Streptococcus uberis in Dairy Herds Using Whole-Genome Sequencing

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In this study, we analyzed 140 S. uberis strains isolated from mastitis milk samples collected from 74 cow herds in the Czech Republic. We employed whole-genome sequencing to screen for the presence of antimicrobial resistance (AMR) genes, genes encoding virulence factors, and to assess their genetic relationships. Our analysis revealed the presence of 88 different sequence types (STs), with 41% of the isolates assigned to global clonal complexes (GCCs), the majority of which were affiliated with GCC5. The STs identified were distributed across the major phylogenetic branches of all currently known STs. We identified fifty-one putative virulence factor genes, and the majority of isolates carried between 27 and 29 of these genes. A tendency of virulence factors and AMR genes to cluster with specific STs was observed, although such clustering was not evident within GCCs. Principal component analysis did not reveal significant diversity among isolates when grouped by GCC or ST prevalence.

  • Název v anglickém jazyce

    Survey of Genotype Diversity, Virulence, and Antimicrobial Resistance Genes in Mastitis-Causing Streptococcus uberis in Dairy Herds Using Whole-Genome Sequencing

  • Popis výsledku anglicky

    In this study, we analyzed 140 S. uberis strains isolated from mastitis milk samples collected from 74 cow herds in the Czech Republic. We employed whole-genome sequencing to screen for the presence of antimicrobial resistance (AMR) genes, genes encoding virulence factors, and to assess their genetic relationships. Our analysis revealed the presence of 88 different sequence types (STs), with 41% of the isolates assigned to global clonal complexes (GCCs), the majority of which were affiliated with GCC5. The STs identified were distributed across the major phylogenetic branches of all currently known STs. We identified fifty-one putative virulence factor genes, and the majority of isolates carried between 27 and 29 of these genes. A tendency of virulence factors and AMR genes to cluster with specific STs was observed, although such clustering was not evident within GCCs. Principal component analysis did not reveal significant diversity among isolates when grouped by GCC or ST prevalence.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40301 - Veterinary science

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/QK1910212" target="_blank" >QK1910212: Moderní metody diagnostiky, terapie a prevence mastitid způsobených Streptococcus uberis jako nástroj pro sestavování cílených kontrolních programů v chovech skotu</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Pathogens

  • ISSN

    2076-0817

  • e-ISSN

    2076-0817

  • Svazek periodika

    12

  • Číslo periodika v rámci svazku

    12

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    001132154400001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85180518895