Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Gene expression imputation across multiple brain regions provides insights into schizophrenia risk

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00064203%3A_____%2F19%3A10394261" target="_blank" >RIV/00064203:_____/19:10394261 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11130/19:10394261

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=sBx-Isz2qs" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=sBx-Isz2qs</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41588-019-0364-4" target="_blank" >10.1038/s41588-019-0364-4</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Gene expression imputation across multiple brain regions provides insights into schizophrenia risk

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Transcriptomic imputation approaches combine eQTL reference panels with large-scale genotype data in order to test associations between disease and gene expression. These genic associations could elucidate signals in complex genome-wide association study (GWAS) loci and may disentangle the role of different tissues in disease development. We used the largest eQTL reference panel for the dorso-lateral prefrontal cortex (DLPFC) to create a set of gene expression predictors and demonstrate their utility. We applied DLPFC and 12 GTEx-brain predictors to 40,299 schizophrenia cases and 65,264 matched controls for a large transcriptomic imputation study of schizophrenia. We identified 413 genic associations across 13 brain regions. Stepwise conditioning identified 67 non-MHC genes, of which 14 did not fall within previous GWAS loci. We identified 36 significantly enriched pathways, including hexosaminidase-A deficiency, and multiple porphyric disorder pathways. We investigated developmental expression patterns among the 67 non-MHC genes and identified specific groups of pre- and postnatal expression.

  • Název v anglickém jazyce

    Gene expression imputation across multiple brain regions provides insights into schizophrenia risk

  • Popis výsledku anglicky

    Transcriptomic imputation approaches combine eQTL reference panels with large-scale genotype data in order to test associations between disease and gene expression. These genic associations could elucidate signals in complex genome-wide association study (GWAS) loci and may disentangle the role of different tissues in disease development. We used the largest eQTL reference panel for the dorso-lateral prefrontal cortex (DLPFC) to create a set of gene expression predictors and demonstrate their utility. We applied DLPFC and 12 GTEx-brain predictors to 40,299 schizophrenia cases and 65,264 matched controls for a large transcriptomic imputation study of schizophrenia. We identified 413 genic associations across 13 brain regions. Stepwise conditioning identified 67 non-MHC genes, of which 14 did not fall within previous GWAS loci. We identified 36 significantly enriched pathways, including hexosaminidase-A deficiency, and multiple porphyric disorder pathways. We investigated developmental expression patterns among the 67 non-MHC genes and identified specific groups of pre- and postnatal expression.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10600 - Biological sciences

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Genetics

  • ISSN

    1061-4036

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    51

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    659-674

  • Kód UT WoS článku

    000462767500013

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85063585118