Polyadenylated Sequencing Primers Enable Complete Readability of PCR Amplicons Analyzed by Dideoxynucleotide Sequencing

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00179906%3A_____%2F12%3A10129164" target="_blank" >RIV/00179906:_____/12:10129164 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11150/12:10129164

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Polyadenylated Sequencing Primers Enable Complete Readability of PCR Amplicons Analyzed by Dideoxynucleotide Sequencing

Popis výsledku v původním jazyce

We present a method which extends the readability by using sequencing primers modified by polyadenylated tails attached to their 5' ends. Performing a polymerase chain reaction, we amplified eight amplicons of six human genes ranging from 106 bp to 680 bp. Polyadenylation of the sequencing primers minimized the loss of bases in all amplicons. Complete sequences of shorter products (AMELX 106 bp, SERPINA1 121 bp, HFE 208 bp, APOE 244 bp, MBL2 317 bp) were obtained. In addition, in the case of TGFB1 products (366 bp, 432 bp, and 680 bp, respectively), the lengths of sequencing readings were significantly longer if adenylated primers were used. Thus, single strand dideoxynucleotide sequencing with adenylated primers enables complete or near complete readability of short PCR amplicons.

Název v anglickém jazyce

Polyadenylated Sequencing Primers Enable Complete Readability of PCR Amplicons Analyzed by Dideoxynucleotide Sequencing

Popis výsledku anglicky

We present a method which extends the readability by using sequencing primers modified by polyadenylated tails attached to their 5' ends. Performing a polymerase chain reaction, we amplified eight amplicons of six human genes ranging from 106 bp to 680 bp. Polyadenylation of the sequencing primers minimized the loss of bases in all amplicons. Complete sequences of shorter products (AMELX 106 bp, SERPINA1 121 bp, HFE 208 bp, APOE 244 bp, MBL2 317 bp) were obtained. In addition, in the case of TGFB1 products (366 bp, 432 bp, and 680 bp, respectively), the lengths of sequencing readings were significantly longer if adenylated primers were used. Thus, single strand dideoxynucleotide sequencing with adenylated primers enables complete or near complete readability of short PCR amplicons.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NT11334" target="_blank" >NT11334: Genetická predikce pozdní toxicity radioterapie cervikálního karcinomu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Acta medica (Hradec Králové) / Universitas Carolina, Facultas Medica Hradec Kralove

ISSN

1211-4286

e-ISSN

—

Svazek periodika

55

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

160-164

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—