Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00179906%3A_____%2F12%3A10128441" target="_blank" >RIV/00179906:_____/12:10128441 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11150/12:10128441

Výsledek na webu

<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2012_08_783-787.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2012_08_783-787.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Jednosměrné sekvenování PCR produktů MBL2 genu pomocí polyadenylovaného sekvenačního primeru

Popis výsledku v původním jazyce

Ve skupině 24 pacientek s rekurentní vulvovaginální kandidózou a 24 zdravých žen jsme analyzovali polymorfní místa v 5' nepřekládaném konci a kodonech 52, 54 a 57 genu MBL2. Pomocí PCR jsme amplifikovali produkty o délce 317 bp, které obsahovaly všechnyzmíněné polymorfní místa. Purifikované amplikony vyly použity pro sekvenační reakce obsahující konvenční a polyadenylované přímé (forward) primery. Prokázali jsme, že polyadenylovaný primer použitý při sekvenační reakci prodlužuje čitelnost MBL2 amplikonů bez nutnosti oboustranného sekvenování, subklonování nebo reamplifikace s jiným párem primerů. Naše předběžná data ukázala, že distribuce alel, haplotypů a genotypů genu MBL2 u osob vulvovaginální kandidózou a zdravých osob se vzájemně statisticky významně neliší.

Název v anglickém jazyce

Single-Strand Sequencing of PCR Products of the MBL2 Gene with a Polyadenylated Sequencing Primer

Popis výsledku anglicky

In a group of 24 patients with recurrent vulvovaginal candidiasis and 24 healthy subjects we analysed polymorphic sites in the 5' untranslated region (5' UTR) and codons 52, 54, and 57 of the MBL2 gene. Using PCR we amplified 317 bp MBL2 products covering all the polymorphisms. Purified amplicons were used in cycle sequencing reactions containing conventional or polyadenylated forward primers. We revealed that the polyadenylated primer used in the cycle sequencing extends the readable range of MBL2 amplicons without necessity of doublestrand sequencing, subcloning or reamplification with other pair of primers. Our preliminary data showed that the distribution of MBL2 alleles, haplotypes, and genotypes in the patients and healthy subjects was very similar and the differences were not statistically significant.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

106

Číslo periodika v rámci svazku

8

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

783-787

Kód UT WoS článku

000314233700011

EID výsledku v databázi Scopus

—