Metody detekce plazmidově vázané kolistinové rezistence mediované geny mcr

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F21%3A10437796" target="_blank" >RIV/00216208:11130/21:10437796 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00064203:_____/21:10437796

Výsledek na webu

<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=aKmWk-8mpx" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=aKmWk-8mpx</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metody detekce plazmidově vázané kolistinové rezistence mediované geny mcr

Popis výsledku v původním jazyce

Úvod: Kolistin je rezervním antibiotikem používaným pro léčbu infekcí způsobených multirezistentními gramnegativními patogeny. Plazmidově vázaná kolistinová rezistence mediovaná geny mcr představuje zvýšené riziko šíření a její výskyt by měl být monitorován. Cílem této práce je diskutovat možné metody detekce a jejich spolehlivost pro vyhledávání tohoto typu rezistence. Materiál a metody: Spolehlivost diskové difuzní metody, Rapid Polymyxin NP testu a dvou typů gradientových testů pro vyhledávání rezistence ke kolistinu mediované geny mcr byla evaluována na 16 humánních a dvou referenčních kmenech Escherichia coli (ke kolistinu citlivé a rezistentní s chromozomální mutací nebo nesoucí gen mcr-1). Referenční metodou pro stanovení rezistence ke kolistinu byla mikrodiluční metoda. Výsledky: Pro cílené vyhledávání kmenů rezistentních ke kolistinu je vhodné použít selektivní médium s přídavkem kolistinu. U získaných izolátů je nutné vždy suspektní kolistinovou rezistenci konfirmovat spolehlivou metodou. Porovnávané gradientové metody i Rapid Polymyxin NP test vykazovaly 100% shodu s referenční mikrodiluční metodou. Při použití diskové difuzní metody byl jednoznačně a správně vyhodnocen výsledek pouze v 11 % a 33 % případů při použití 10 μg a 50 μg disku. Jedná se tedy o metodu nevhodnou pro vyhledávání kolistinové rezistence. Závěr: Prospektivní prevalenční studie střevního nosičství u hospitalizovaných pacientů a cestovatelů v České republice prozatím nenaznačují rozšíření kmenů s plazmidově kódovanou rezistencí ke kolistinu mediovanou geny mcr. Nicméně vysoká prevalence kmenů nesoucích geny mcr ve výrobcích ze syrového masa představuje riziko expozice pro jejich konzumenty. Při rutinním mikrobiologickém vyšetření nelze předpokládat, že ke kolistinu rezistentní kmeny nesoucí geny mcr budou odhaleny bez cíleného vyhledávání s použitím spolehlivých, ale nákladných metod. Vhodnou alternativní metodou pro aktivní vyhledávání rezistence ke kolistinu je selektivní kultivace na půdách s kolistinem s ověřením rezistence u zachycených izolátů.

Název v anglickém jazyce

Methods for detection of plasmid-bound colistin resistance mediated by mcr genes

Popis výsledku anglicky

Background: Colistin is a last-resort antibiotic used for the treatment of infections caused by multidrug-resistant gram-negative pathogens. The emergence of plasmid-borne colistin resistance mediated by the mcr genes, poses a risk of its spread and its occurrence should be monitored. The aim of this study is to discuss possible detection methods and their reliability in screening for this type of resistance. Material and methods: The reliability of the disk diffusion, the Rapid Polymyxin NP test, and two types of gradient tests for the screening of mcr-mediated colistin resistance was evaluated on 16 human and two reference isolates of Escherichia coli (colistin-susceptible and colistin-resistant with chromosomally-mediated resistance or harbouring the mcr-1 gene). The broth microdilution was the reference method used for the determination of colistin resistance. Results: For the targeted screening of colistin-resistant strains, a selective agar supplemented with colistin can be used and colistin resistance can be confirmed in cultured isolates. The gradient methods and the Rapid Polymyxin NP test agreed 100% with the reference broth microdilution method. Using the disk diffusion with 10μg and 50μg disks, only 11% and 33% of results were correct, respectively. Therefore, disk diffusion is an inappropriate method for the screening of colistin resistance. Conclusion: Prospective prevalence studies of intestinal carriage of colistin resistant Enterobacterales among Czech hospitalized patients and travellers do not yet indicate the spread of strains with mcr-mediated plasmid-borne colistin resistance. However, the high prevalence of strains carrying the mcr genes in raw meat products poses a risk of exposure to their consumers. The detection of mcr-harbouring colistin-resistant strains cannot be expected during routine microbiological testing, without using reliable but expensive methods. The active screening cultures for monitoring of colistin resistance can be performed on selective agar with colistin followed by verification of the resistance in the obtained isolates.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

30303 - Infectious Diseases

Projekt

<a href="/cs/project/NV18-09-00254" target="_blank" >NV18-09-00254: Sentinelová studie výskytu na plazmid vázané (přenositelné) rezistence ke kolistinu u Enterobacteriaceae v České republice</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Svazek periodika

27

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

128-134

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85125429029