Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F20%3A10414591" target="_blank" >RIV/00216208:11310/20:10414591 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=rodGhFFvcR" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=rodGhFFvcR</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.7554/eLife.51737" target="_blank" >10.7554/eLife.51737</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch
Popis výsledku v původním jazyce
Optogenetic tools have revolutionized the study of receptor-mediated processes, but such tools are lacking for RNA-controlled systems. In particular, light-activated regulatory RNAs are needed for spatiotemporal control of gene expression. To fill this gap, we used in vitro selection to isolate a novel riboswitch that selectively binds the trans isoform of a stiff-stilbene (amino-tSS)-a rapidly and reversibly photoisomerizing small molecule. Structural probing revealed that the RNA binds amino-tSS about 100-times stronger than the cis photoisoform (amino-cSS). In vitro and in vivo functional analysis showed that the riboswitch, termed Werewolf-1 (Were-1), inhibits translation of a downstream open reading frame when bound to amino-tSS. Photoisomerization of the ligand with a sub-millisecond pulse of light induced the protein expression. In contrast, amino-cSS supported protein expression, which was inhibited upon photoisomerization to amino-tSS. Reversible photoregulation of gene expression using a genetically encoded RNA will likely facilitate high-resolution spatiotemporal analysis of complex RNA processes.
Název v anglickém jazyce
Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch
Popis výsledku anglicky
Optogenetic tools have revolutionized the study of receptor-mediated processes, but such tools are lacking for RNA-controlled systems. In particular, light-activated regulatory RNAs are needed for spatiotemporal control of gene expression. To fill this gap, we used in vitro selection to isolate a novel riboswitch that selectively binds the trans isoform of a stiff-stilbene (amino-tSS)-a rapidly and reversibly photoisomerizing small molecule. Structural probing revealed that the RNA binds amino-tSS about 100-times stronger than the cis photoisoform (amino-cSS). In vitro and in vivo functional analysis showed that the riboswitch, termed Werewolf-1 (Were-1), inhibits translation of a downstream open reading frame when bound to amino-tSS. Photoisomerization of the ligand with a sub-millisecond pulse of light induced the protein expression. In contrast, amino-cSS supported protein expression, which was inhibited upon photoisomerization to amino-tSS. Reversible photoregulation of gene expression using a genetically encoded RNA will likely facilitate high-resolution spatiotemporal analysis of complex RNA processes.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10401 - Organic chemistry
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GJ17-25897Y" target="_blank" >GJ17-25897Y: Vývoj fluorescenčních substrátů pro methionin sulfoxid reduktázu a zobecnění designu pro další enzymy</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
eLife
ISSN
2050-084X
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
February
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
21
Strana od-do
e51737
Kód UT WoS článku
000518779200001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85081129367