Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F20%3A10414591" target="_blank" >RIV/00216208:11310/20:10414591 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=rodGhFFvcR" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=rodGhFFvcR</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.7554/eLife.51737" target="_blank" >10.7554/eLife.51737</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Optogenetic tools have revolutionized the study of receptor-mediated processes, but such tools are lacking for RNA-controlled systems. In particular, light-activated regulatory RNAs are needed for spatiotemporal control of gene expression. To fill this gap, we used in vitro selection to isolate a novel riboswitch that selectively binds the trans isoform of a stiff-stilbene (amino-tSS)-a rapidly and reversibly photoisomerizing small molecule. Structural probing revealed that the RNA binds amino-tSS about 100-times stronger than the cis photoisoform (amino-cSS). In vitro and in vivo functional analysis showed that the riboswitch, termed Werewolf-1 (Were-1), inhibits translation of a downstream open reading frame when bound to amino-tSS. Photoisomerization of the ligand with a sub-millisecond pulse of light induced the protein expression. In contrast, amino-cSS supported protein expression, which was inhibited upon photoisomerization to amino-tSS. Reversible photoregulation of gene expression using a genetically encoded RNA will likely facilitate high-resolution spatiotemporal analysis of complex RNA processes.

  • Název v anglickém jazyce

    Regulation of mRNA translation by a photoriboswitch

  • Popis výsledku anglicky

    Optogenetic tools have revolutionized the study of receptor-mediated processes, but such tools are lacking for RNA-controlled systems. In particular, light-activated regulatory RNAs are needed for spatiotemporal control of gene expression. To fill this gap, we used in vitro selection to isolate a novel riboswitch that selectively binds the trans isoform of a stiff-stilbene (amino-tSS)-a rapidly and reversibly photoisomerizing small molecule. Structural probing revealed that the RNA binds amino-tSS about 100-times stronger than the cis photoisoform (amino-cSS). In vitro and in vivo functional analysis showed that the riboswitch, termed Werewolf-1 (Were-1), inhibits translation of a downstream open reading frame when bound to amino-tSS. Photoisomerization of the ligand with a sub-millisecond pulse of light induced the protein expression. In contrast, amino-cSS supported protein expression, which was inhibited upon photoisomerization to amino-tSS. Reversible photoregulation of gene expression using a genetically encoded RNA will likely facilitate high-resolution spatiotemporal analysis of complex RNA processes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10401 - Organic chemistry

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GJ17-25897Y" target="_blank" >GJ17-25897Y: Vývoj fluorescenčních substrátů pro methionin sulfoxid reduktázu a zobecnění designu pro další enzymy</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    eLife

  • ISSN

    2050-084X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    February

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    21

  • Strana od-do

    e51737

  • Kód UT WoS článku

    000518779200001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85081129367