Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Convergent evolution and horizontal gene transfer in Arctic Ocean microalgae

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F22%3A10454886" target="_blank" >RIV/00216208:11310/22:10454886 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=tdtaZv7gD0" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=tdtaZv7gD0</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.26508/lsa.202201833" target="_blank" >10.26508/lsa.202201833</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Convergent evolution and horizontal gene transfer in Arctic Ocean microalgae

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Microbial communities in the world ocean are affected strongly by oceanic circulation, creating characteristic marine biomes. The high connectivity of most of the ocean makes it difficult to dis-entangle selective retention of colonizing genotypes (with traits suited to biome specific conditions) from evolutionary selection, which would act on founder genotypes over time. The Arctic Ocean is exceptional with limited exchange with other oceans and ice covered since the last ice age. To test whether Arctic microalgal lineages evolved apart from algae in the global ocean, we sequenced four lineages of microalgae isolated from Arctic waters and sea ice. Here we show convergent evolution and highlight geographically limited HGT as an ecological adaptive force in the form of PFAM complements and horizontal acquisition of key adaptive genes. Notably, ice-binding proteins were acquired and hori-zontally transferred among Arctic strains. A comparison with Tara Oceans metagenomes and metatranscriptomes confirmed mostly Arctic distributions of these IBPs. The phylogeny of Arctic-specific genes indicated that these events were inde-pendent of bacterial-sourced HGTs in Antarctic Southern Ocean microalgae.

  • Název v anglickém jazyce

    Convergent evolution and horizontal gene transfer in Arctic Ocean microalgae

  • Popis výsledku anglicky

    Microbial communities in the world ocean are affected strongly by oceanic circulation, creating characteristic marine biomes. The high connectivity of most of the ocean makes it difficult to dis-entangle selective retention of colonizing genotypes (with traits suited to biome specific conditions) from evolutionary selection, which would act on founder genotypes over time. The Arctic Ocean is exceptional with limited exchange with other oceans and ice covered since the last ice age. To test whether Arctic microalgal lineages evolved apart from algae in the global ocean, we sequenced four lineages of microalgae isolated from Arctic waters and sea ice. Here we show convergent evolution and highlight geographically limited HGT as an ecological adaptive force in the form of PFAM complements and horizontal acquisition of key adaptive genes. Notably, ice-binding proteins were acquired and hori-zontally transferred among Arctic strains. A comparison with Tara Oceans metagenomes and metatranscriptomes confirmed mostly Arctic distributions of these IBPs. The phylogeny of Arctic-specific genes indicated that these events were inde-pendent of bacterial-sourced HGTs in Antarctic Southern Ocean microalgae.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Life Science Alliance [online]

  • ISSN

    2575-1077

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    20

  • Strana od-do

    e202201833

  • Kód UT WoS článku

    000905565300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85144202443