Parametrised Hausdorff Distance as a Non-Metric Similarity Model for Tandem Mass Spectrometry

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F10%3A10033413" target="_blank" >RIV/00216208:11320/10:10033413 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Parametrised Hausdorff Distance as a Non-Metric Similarity Model for Tandem Mass Spectrometry

Popis výsledku v původním jazyce

Tandem mass spectrometry is a widely used method for protein and peptide sequences identification. Since the mass spectra contain up to 80% of noise and many other inaccuracies, there still exists a need for more accurate algorithms for mass spectra interpretation. The sizes of protein databases grow rapidly and the methods for indexing these databases in order to interpret mass spectra become very popular. The parametrised Hausdorff distance, suitable for non-metric search, is presented in this paper.It models the similarity among tandem mass spectra very well and it is able to match the spectrum to correct peptide sequence in many cases without any post-processing scoring system.

Název v anglickém jazyce

Parametrised Hausdorff Distance as a Non-Metric Similarity Model for Tandem Mass Spectrometry

Popis výsledku anglicky

Tandem mass spectrometry is a widely used method for protein and peptide sequences identification. Since the mass spectra contain up to 80% of noise and many other inaccuracies, there still exists a need for more accurate algorithms for mass spectra interpretation. The sizes of protein databases grow rapidly and the methods for indexing these databases in order to interpret mass spectra become very popular. The parametrised Hausdorff distance, suitable for non-metric search, is presented in this paper.It models the similarity among tandem mass spectra very well and it is able to match the spectrum to correct peptide sequence in many cases without any post-processing scoring system.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA201%2F09%2F0683" target="_blank" >GA201/09/0683: Vyhledávání v rozsáhlých multimediálních databázích</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of the Dateso 2010 Annual International Workshop on DAtabases, TExts, Specifications and Objects

ISBN

—

ISSN

1613-0073

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

—

Název nakladatele

MATFYZPRESS

Místo vydání

Prague

Místo konání akce

Stedronin-Plazy, Czech Republic

Datum konání akce

21. 4. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—