SimTandem: Similarity Search in Tandem Mass Spectra

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F12%3A10124005" target="_blank" >RIV/00216208:11320/12:10124005 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-32153-5_18" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-32153-5_18</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-32153-5_18" target="_blank" >10.1007/978-3-642-32153-5_18</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

SimTandem: Similarity Search in Tandem Mass Spectra

Popis výsledku v původním jazyce

SimTandem is a tool for fast identification of protein and peptide sequences from tandem mass spectra. The identification is based on similarity search of spectra captured by a tandem mass spectrometer in databases of theoretical mass spectra generated from databases of known protein sequences. Since the number of protein sequences in the databases grows rapidly and a sequential scan over the entire database of spectra is time-consuming, the non-metric access methods are employed as the database indexing techniques. SimTandem is based on a previously proposed method and is freely available at http://www.simtandem.org or http://www.siret.cz/simtandem.

Název v anglickém jazyce

SimTandem: Similarity Search in Tandem Mass Spectra

Popis výsledku anglicky

SimTandem is a tool for fast identification of protein and peptide sequences from tandem mass spectra. The identification is based on similarity search of spectra captured by a tandem mass spectrometer in databases of theoretical mass spectra generated from databases of known protein sequences. Since the number of protein sequences in the databases grows rapidly and a sequential scan over the entire database of spectra is time-consuming, the non-metric access methods are employed as the database indexing techniques. SimTandem is based on a previously proposed method and is freely available at http://www.simtandem.org or http://www.siret.cz/simtandem.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Lecture Notes in Computer Science

ISSN

0302-9743

e-ISSN

—

Svazek periodika

2012

Číslo periodika v rámci svazku

7404

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

242-243

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—