MultiSETTER - Multiple RNA Structure Similarity Algorithm
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F13%3A10139297" target="_blank" >RIV/00216208:11320/13:10139297 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-02624-4_6" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-02624-4_6</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-02624-4_6" target="_blank" >10.1007/978-3-319-02624-4_6</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
MultiSETTER - Multiple RNA Structure Similarity Algorithm
Popis výsledku v původním jazyce
Recent advances in RNA research and a steady growth of available RNA structures call for bioinformatics methods for handling RNA structural data. Recently, we have introduced SETTER - a fast and accurate method for RNA pairwise structural alignment. In the present contribution we describe its extension for multiple RNA structure alignment called MultiSETTER. It combines SETTER's decomposition of RNA structures into disjoint fragments with a well known multiple sequence alignment algorithm ClustalW adapted for the structural alignment. We demonstrate the validity of our approach on the task of automatic classification of RNA structures.
Název v anglickém jazyce
MultiSETTER - Multiple RNA Structure Similarity Algorithm
Popis výsledku anglicky
Recent advances in RNA research and a steady growth of available RNA structures call for bioinformatics methods for handling RNA structural data. Recently, we have introduced SETTER - a fast and accurate method for RNA pairwise structural alignment. In the present contribution we describe its extension for multiple RNA structure alignment called MultiSETTER. It combines SETTER's decomposition of RNA structures into disjoint fragments with a well known multiple sequence alignment algorithm ClustalW adapted for the structural alignment. We demonstrate the validity of our approach on the task of automatic classification of RNA structures.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
IN - Informatika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP202%2F11%2F0968" target="_blank" >GAP202/11/0968: Podobnostní nemetrické vyhledávání v rozsáhlých komplexních databázích</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Advances in Bioinformatics and Computational Biology
ISBN
978-3-319-02623-7
ISSN
0302-9743
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
59-70
Název nakladatele
Springer
Místo vydání
Berlin
Místo konání akce
Recife
Datum konání akce
3. 11. 2013
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—