Transcriptom Treponema pallidum: expresní profilování během experimentální infekce králíků

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F03%3A00012307" target="_blank" >RIV/00216224:14110/03:00012307 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Transcriptom Treponema pallidum: expresní profilování během experimentální infekce králíků

Popis výsledku v původním jazyce

Byl vyšetřen transkriptom Treponema pallidum během experimentální infekce králíků pomocí DNA microarray čipů obsahujících všech 1039 anotovaných ORF. Geny Treponema pallidum byly rozděleny do skupin podle úrovně transkripce.

Název v anglickém jazyce

Transcriptome of Treponema pallidum: gene expression profiling of treponemes grown in rabbits

Popis výsledku anglicky

DNA microarray chips containing all 1039 annotated ORFs of Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols) were printed on glass slides. For 1034 ORFs (out of 1039), signals higher than threshold (average of negative control spots + 3 SDs) were detected forboth labeled RNA and DNA. Total RNA isolated from treponemes grown in rabbit testes was labeled and standardized to the labeled treponemal chromosomal DNA. Genes were sorted according to the relative transcription level and the operon structure of T. pallidum genome was proposed. The most intensively transcribed genes were found to correlate with most prominent spots identified on 2D SDS PAGE gels indicating that the transcription rate approximately corresponds to the level of protein synthesis. Gene expression of 84 genes was independently measured using real-time PCR approach and the results were compared to the data obtained by DNA microarray technique. In addition, expression levels of treponemal genes were measured using large ins

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NI7351" target="_blank" >NI7351: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník příspěvků VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů

ISBN

80-210-3053-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

12

Název nakladatele

Masarykova univerzita

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

29. 1. 2003

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—