Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F03%3A00012309" target="_blank" >RIV/00216224:14110/03:00012309 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků

Popis výsledku v původním jazyce

Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou

Název v anglickém jazyce

Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection

Popis výsledku anglicky

DNA microarray technology was utilized to study gene expression by the syphilis spirochete Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols) isolated from rabbit testes 10 days post infection. Microarrays containing all 1039 annotated ORFs of Treponema pallidum subspecies pallidum (Nichols) were printed on glass slides. For 1034 ORFs (out of 1039), signals higher than the threshold (average of negative control spots + 3 SDs) were detected for both RNA and DNA probes. The most highly transcribed genes were found to correlate with the most conspicuous spots identified by two dimensional gel electrophoresis, indicating that the transcript levels generally corresponded to the relative protein concentrations. Genes with high transcript concentrations included those encoding flagellar filament and cytoplasmic filament proteins, prominent lipoproteins and membrane proteins, chaperonins, proteins involved in red-ox balance, chemotaxis regulatory proteins, a V-ATPase operon, and certain metabolic en

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NI7351" target="_blank" >NI7351: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

14-15

Název nakladatele

Lékařská fakulta MU

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno, Komenského nám. 2

Datum konání akce

4. 6. 2003

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—