Estimation Procedures for the False Discovery Rate: A Systematic Comparison for Microarray Data

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F06%3A00031811" target="_blank" >RIV/00216224:14110/06:00031811 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Estimation Procedures for the False Discovery Rate: A Systematic Comparison for Microarray Data

Popis výsledku v původním jazyce

The microarray technology developed in recent years allows for measuring expression levels of thousands of genes simultaneously. In most microarray experiments the measurements are taken under two experimental conditions. Statistical procedures to identify differentially expressed genes involve a serious multiple comparison problem as we have to carry out as many hypothesis testings as the number of candidate genes in the experiment. If we apply the usual type I error rate alpha in each testing, then the probability to reject any truly null hypothesis will greatly exceed the intended overall alpha level. We focus on the recent error control concept of the false discovery rate FDR for which an increasing number of competing estimates as well as algorithms is available. However, there is little comparative evidence.

Název v anglickém jazyce

Estimation Procedures for the False Discovery Rate: A Systematic Comparison for Microarray Data

Popis výsledku anglicky

The microarray technology developed in recent years allows for measuring expression levels of thousands of genes simultaneously. In most microarray experiments the measurements are taken under two experimental conditions. Statistical procedures to identify differentially expressed genes involve a serious multiple comparison problem as we have to carry out as many hypothesis testings as the number of candidate genes in the experiment. If we apply the usual type I error rate alpha in each testing, then the probability to reject any truly null hypothesis will greatly exceed the intended overall alpha level. We focus on the recent error control concept of the false discovery rate FDR for which an increasing number of competing estimates as well as algorithms is available. However, there is little comparative evidence.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

BB - Aplikovaná statistika, operační výzkum

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

COMPSTAT 2006 - Proceedings in Computational Statistics

ISBN

3-7908-1708-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

—

Název nakladatele

Springer Verlag

Místo vydání

Rome, Italy

Místo konání akce

Rome, Italy

Datum konání akce

1. 1. 2006

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000242170000006