Zmapovanie interakcií kolicínov U a Y s receptorom OmpA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F08%3A00027995" target="_blank" >RIV/00216224:14110/08:00027995 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14110/06:00024044

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Zmapovanie interakcií kolicínov U a Y s receptorom OmpA

Popis výsledku v původním jazyce

OmpA (outer membrane protein A) je proteín bunečného povrchu gramnegatívnych baktérií, tvorený dvoma doménami, transmembránovým b súdkom a globulárnou C doménou v periplazme. Predpokladá sa význam OmpA pri spojení vonkajšej membrány s peptidoglykánom. OmpA je využívaný tiež ako receptor baktériofágov a kolicínov. Interakcia s OmpA bola potvrdená u štyroch kolícínov U, Y, K a L. Ako receptor zodpovedný za primárnu interakciu sa uplatňuje iba v prípade kolicínov U a Y. U zvyšných dvoch kolicínov (K a L) ma funkciu pomocnú. Baktérie rodu Escherichia coli a Enterobacter aerogenes, líšiace sa v citlivosti ku kolicínom U, Y, K a L, syntetizujú OmpA s rozdielnou sekvenciou aminokyselín. Identifikované variabilné oblasti povrchových slučiek boli rozdelené na 11 segmentov o dĺžke 1 až 3 aminokyseliny. Tieto segmenty boli následne mutagenizované pomocou PCR. 11 párov navrhnutých primerov nieslo špecifickú mutáciu, obsahujúcu sekvenciu aminokyselín z OmpA E. aerogenes. Ako templát pri amplifikáci

Název v anglickém jazyce

Mapping the interactions of colicins U and Y with their receptor OmpA

Popis výsledku anglicky

OmpA (outer membrane protein A) is an important protein of gramnegative bacteria cell envelope. It contains two domains transmembrane b-barrel and periplasmic globular C domain. It is supposed the importance of this protein in connection of outer membrane with rigid peptidoglycan layer. OmpA acts also as a receptor for many antibacterial agens bacteriophages and colicins. OmpA interacts with four colicins U, Y, K, and L. For colicins U and Y, OmpA has a major receptor function, whereas for colicin K andL, it is only a protein helping with transport. Bacteria of strains Escherichia coli and Enterobacter aerogenes differ in their sensitivity to colicins U and Y. These two strains have variability in OmpA sequence. Variable amino acids of OmpA extracellular loops were distributed into 11 segments. Every segment was built of 1 to 3 amino acids. We used PCR in mutagenesis of OmpAs segments. We proposed 11 pairs of primers. Every primers pair has a specific sequence from insensitive OmpA of

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů