Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F12%3A00057665" target="_blank" >RIV/00216224:14110/12:00057665 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784" target="_blank" >http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.4056/sigs.2615838" target="_blank" >10.4056/sigs.2615838</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1
Popis výsledku v původním jazyce
Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.
Název v anglickém jazyce
Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1
Popis výsledku anglicky
Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA310%2F07%2F0321" target="_blank" >GA310/07/0321: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Standards in Genomic Sciences
ISSN
1944-3277
e-ISSN
—
Svazek periodika
7
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—