A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F15%3A00081223" target="_blank" >RIV/00216224:14110/15:00081223 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00027162:_____/15:#0001309
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0004110" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0004110</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0004110" target="_blank" >10.1371/journal.pntd.0004110</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
Popis výsledku v původním jazyce
BACKGROUND: Pathogenic uncultivable treponemes comprise human and animal pathogens including agents of syphilis, yaws, bejel, pinta, and venereal spirochetosis in rabbits and hares. A set of 10 treponemal genome sequences including those of 4 Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) strains (Nichols, DAL-1, Mexico A, SS14), 4 T. p. ssp. pertenue (TPE) strains (CDC-2, Gauthier, Samoa D, Fribourg-Blanc), 1 T. p. ssp. endemicum (TEN) strain (Bosnia A) and one strain (Cuniculi A) of Treponema paraluisleporidarum ecovar Cuniculus (TPLC) were examined with respect to the presence of nucleotide intrastrain heterogeneous sites. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The number of identified intrastrain heterogeneous sites in individual genomes ranged between 0 and 7. Altogether, 23 intrastrain heterogeneous sites (in 17 genes) were found in 5 out of 10 investigated treponemal genomes including TPA strains Nichols (n = 5), DAL-1 (n = 4), and SS14 (n = 7), TPE strain Samoa D (n = 1), and TEN strain Bosni
Název v anglickém jazyce
A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
Popis výsledku anglicky
BACKGROUND: Pathogenic uncultivable treponemes comprise human and animal pathogens including agents of syphilis, yaws, bejel, pinta, and venereal spirochetosis in rabbits and hares. A set of 10 treponemal genome sequences including those of 4 Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) strains (Nichols, DAL-1, Mexico A, SS14), 4 T. p. ssp. pertenue (TPE) strains (CDC-2, Gauthier, Samoa D, Fribourg-Blanc), 1 T. p. ssp. endemicum (TEN) strain (Bosnia A) and one strain (Cuniculi A) of Treponema paraluisleporidarum ecovar Cuniculus (TPLC) were examined with respect to the presence of nucleotide intrastrain heterogeneous sites. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The number of identified intrastrain heterogeneous sites in individual genomes ranged between 0 and 7. Altogether, 23 intrastrain heterogeneous sites (in 17 genes) were found in 5 out of 10 investigated treponemal genomes including TPA strains Nichols (n = 5), DAL-1 (n = 4), and SS14 (n = 7), TPE strain Samoa D (n = 1), and TEN strain Bosni
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS Neglected Tropical Diseases
ISSN
1935-2735
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
19
Strana od-do
1-19
Kód UT WoS článku
000364459600023
EID výsledku v databázi Scopus
—