Rychlá identifikace ESBL-pozitivních klinických vzorků metodou real-time PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F13%3A00070067" target="_blank" >RIV/00216224:14110/13:00070067 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00098892:_____/13:#0000496 RIV/61989592:15110/13:33144513

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Rychlá identifikace ESBL-pozitivních klinických vzorků metodou real-time PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cíl práce: Vyvinout metodu detekce genů podmiňujících ESBL (extended spectrum beta lactamase) fenotyp bakterií přímo z klinického materiálu pacienta. Metoda umožňuje detekci genu blaTX-M kódujícího CTX-M beta-laktamázy a detekci variant WaSHV genu technologií real-time PCR s využitím locked nucleic acid (LNA) oligonukleotidů. Materiál a metody: V pilotní studii byly testovány tracheální aspiráty získané od pacientů s umělou plicní ventilací hospitalizovaných na oddělení KAR FN Olomouc v období 1. 3. až30. 8. 2010. Každý vzorek byl standardně mikrobiologicky vyšetřen, u enterobakterií bylo provedeno fenotypové stanovení přítomnosti ESBL. Každý klinický materiál byl současně podroben analýze na přítomnost nu-kleových kyselin (DNA) kódujících CTX-M a SHVESBL beta-laktamázy metodou real-time PCR. Výsledky: Do testování bylo zařazeno 150 vzorků tracheálního aspirátu od 71 pacientů.

Název v anglickém jazyce

Rapid identification of ESBL-positive clinical samples using real-time PCR method

Popis výsledku anglicky

Objectives: A new method has been developed for detecting genes determining the extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) pheno-type directly from patients' clinical material. The method enables detection of the WacTX M gene encoding CTX-M beta-lactamasesand the WaSHv gene variants with real-time PCR technology using locked nucleic acid oligonucleotides. Material and methods: In this pilot study, tracheal aspirates obtained from patients with mechanical ventilation hospitalized at Department of Anaesthesiology and Resuscitation of the University Hospital in Olomouc between 1s' March and 30lh December 2010 period were tested. Each sample was identified with standard microbiological procedures including phenotypic determination of ESBL-positive enterobacteria. At the same time, each sample was analyzed for the presence of nucleic acids (DNA) which encode CTX-M and SHV ESBL using real-time PCR . Results: 150 samples of tracheal aspirates from 71 patients were included into testing. In the

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NS9950" target="_blank" >NS9950: Molekulárně-biologická analýza a klinický význam širokospektrých beta-laktamáz v podmínkách České republiky</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Svazek periodika

19

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

80-84

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—