Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/00216224:14310/09:00036231 - isvavai.cz

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism

Popis výsledku v původním jazyce

Trf4p and Trf5p are non canonical poly(A) polymerases and are part of the heteromeric protein complexes TRAMP4 and TRAMP5 that promote the degradation of aberrant and short lived RNA substrates by interacting with the nuclear exosome. To assess the levelof functional redundancy between the paralogous Trf4 and Trf5 proteins and to investigate the role of the Trf4 dependent polyadenylation in vivo, we used DNA microarrays to compare gene expression of the wild-type yeast strain of S. cerevisiae with either that of trf4delta or trf5delta mutant strains or the trf4delta mutant expressing the polyadenylation-defective Trf4(DADA) protein. We found little overlap between the sets of transcripts with altered expression in the trf4delta or the trf5delta mutants, suggesting that Trf4p and Trf5p target distinct groups of RNAs for degradation.

Název v anglickém jazyce

Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism

Popis výsledku anglicky

Trf4p and Trf5p are non canonical poly(A) polymerases and are part of the heteromeric protein complexes TRAMP4 and TRAMP5 that promote the degradation of aberrant and short lived RNA substrates by interacting with the nuclear exosome. To assess the levelof functional redundancy between the paralogous Trf4 and Trf5 proteins and to investigate the role of the Trf4 dependent polyadenylation in vivo, we used DNA microarrays to compare gene expression of the wild-type yeast strain of S. cerevisiae with either that of trf4delta or trf5delta mutant strains or the trf4delta mutant expressing the polyadenylation-defective Trf4(DADA) protein. We found little overlap between the sets of transcripts with altered expression in the trf4delta or the trf5delta mutants, suggesting that Trf4p and Trf5p target distinct groups of RNAs for degradation.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

PLoS Genetics

ISSN

1553-7390

e-ISSN

—

Svazek periodika

5

Číslo periodika v rámci svazku

7

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

17

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000269219500032

EID výsledku v databázi Scopus

—