BOX COUNTING METHOD IN RECORD, PROCESSING AND EVALUATION OF GENOMIC SIGNALS
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F10%3A00040547" target="_blank" >RIV/00216224:14310/10:00040547 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216305:26220/10:PU88077 RIV/62156489:43210/10:00166811
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
BOX COUNTING METHOD IN RECORD, PROCESSING AND EVALUATION OF GENOMIC SIGNALS
Popis výsledku v původním jazyce
Fractals are geometrical shapes with noninteger dimension and invariation against change of scale factor. For each geometrical shape, one parameter, dimension, can be calculated. For calculation, Box Counting Method (BCM) was chosen. Determination of dimension on one level of resolution is not sufficient, it is necessary to subsequently process it and determine multifractal coefficient. Aim of interest consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Results of calculation are fractal coefficients derived from dimensions of generated structures. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB. Origin of data is in public database EMBL (ESI) and GenBank (NCBI).
Název v anglickém jazyce
BOX COUNTING METHOD IN RECORD, PROCESSING AND EVALUATION OF GENOMIC SIGNALS
Popis výsledku anglicky
Fractals are geometrical shapes with noninteger dimension and invariation against change of scale factor. For each geometrical shape, one parameter, dimension, can be calculated. For calculation, Box Counting Method (BCM) was chosen. Determination of dimension on one level of resolution is not sufficient, it is necessary to subsequently process it and determine multifractal coefficient. Aim of interest consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Results of calculation are fractal coefficients derived from dimensions of generated structures. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB. Origin of data is in public database EMBL (ESI) and GenBank (NCBI).
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
CB - Analytická chemie, separace
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
X. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků - sborník příspěvků
ISBN
978-80-7375-396-2
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Název nakladatele
Mendelova univerzita v Brně
Místo vydání
Brno
Místo konání akce
Brno
Datum konání akce
23. 6. 2010
Typ akce podle státní příslušnosti
EUR - Evropská akce
Kód UT WoS článku
—