Power spectrum method in record, evaluatin and processing of genomic signals II.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F10%3APU90314" target="_blank" >RIV/00216305:26220/10:PU90314 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Power spectrum method in record, evaluatin and processing of genomic signals II.

Popis výsledku v původním jazyce

Fractals are geometrical shapes with noninteger dimension and invariation against change of scale factor. For each geometrical shape, one parameter - dimension - can be calculated. For calculation, Power Spectrum Method (PSM) was chosen. Aim of work consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Result of calculation is dimension derived from sequences of generated texture. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB. Origin of data is in public database EMBL (ESI) and GenBank (NCBI).

Název v anglickém jazyce

Power spectrum method in record, evaluatin and processing of genomic signals II.

Popis výsledku anglicky

Fractals are geometrical shapes with noninteger dimension and invariation against change of scale factor. For each geometrical shape, one parameter - dimension - can be calculated. For calculation, Power Spectrum Method (PSM) was chosen. Aim of work consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Result of calculation is dimension derived from sequences of generated texture. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB. Origin of data is in public database EMBL (ESI) and GenBank (NCBI).

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GD102%2F09%2FH083" target="_blank" >GD102/09/H083: Informační technologie v biomedicínském inženýrství</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

8th Annual Rocky Mountain Bioinformatics Conference

ISBN

978-1-4244-6560-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

—

Název nakladatele

Neuveden

Místo vydání

USA

Místo konání akce

Snowmass vilage

Datum konání akce

9. 12. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—