Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor kappa B (NF-kappa B) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F15%3A00080960" target="_blank" >RIV/00216224:14310/15:00080960 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1074/mcp.M114.041335" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1074/mcp.M114.041335</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1074/mcp.M114.041335" target="_blank" >10.1074/mcp.M114.041335</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor kappa B (NF-kappa B) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer
Popis výsledku v původním jazyce
Current prognostic factors are insufficient for precise risk-discrimination in breast cancer patients with low grade breast tumors, which, in disagreement with theoretical prognosis, occasionally form early lymph node metastasis. To identify markers forthis group of patients, we employed iTRAQ-2DLC-MS/MS proteomics to 24 lymph node positive and 24 lymph node negative grade 1 luminal A primary breast tumors. Another group of 48 high-grade tumors (luminal B, triple negative, Her-2 subtypes) was also analyzed to investigate marker specificity for grade 1 luminal A tumors. From the total of 4405 proteins identified (FDR<5%), the top 65 differentially expressed together with 30 previously identified and control markers were analyzed also at transcript level.
Název v anglickém jazyce
Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor kappa B (NF-kappa B) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer
Popis výsledku anglicky
Current prognostic factors are insufficient for precise risk-discrimination in breast cancer patients with low grade breast tumors, which, in disagreement with theoretical prognosis, occasionally form early lymph node metastasis. To identify markers forthis group of patients, we employed iTRAQ-2DLC-MS/MS proteomics to 24 lymph node positive and 24 lymph node negative grade 1 luminal A primary breast tumors. Another group of 48 high-grade tumors (luminal B, triple negative, Her-2 subtypes) was also analyzed to investigate marker specificity for grade 1 luminal A tumors. From the total of 4405 proteins identified (FDR<5%), the top 65 differentially expressed together with 30 previously identified and control markers were analyzed also at transcript level.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA14-19250S" target="_blank" >GA14-19250S: Nový panel proteinů korelujících se stavem lymfatických uzlin u low-grade nádorů prsu: Klinická verifikace a úloha v invazivitě nádorových buněk</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
ISSN
1535-9476
e-ISSN
—
Svazek periodika
14
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
1814-1830
Kód UT WoS článku
000357434400007
EID výsledku v databázi Scopus
—