Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14610%2F16%3A00088323" target="_blank" >RIV/00216224:14610/16:00088323 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics
Popis výsledku v původním jazyce
In this paper, we introduce GPU acceleration of RMSD approximation, which is computationally demanding task in molecular metadynamics. Comparing to tuned CPU implementation, we have reached 4.4x speedup using mid-end GPU. The scaling of our GPU implementation is sufficient to be usable in real-world application.
Název v anglickém jazyce
Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics
Popis výsledku anglicky
In this paper, we introduce GPU acceleration of RMSD approximation, which is computationally demanding task in molecular metadynamics. Comparing to tuned CPU implementation, we have reached 4.4x speedup using mid-end GPU. The scaling of our GPU implementation is sufficient to be usable in real-world application.

Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku
Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference
ISBN
9789077381953
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
278-280
Název nakladatele
EUROSIS - ETI
Místo vydání
Ghent, Belgie
Místo konání akce
Las Palmas, Španielsko
Datum konání akce
25. 10. 2016
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—

Podobné výsledky(10)