The structure and substrate specificity of human Cdk12/Cyclin K
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F14%3A00073691" target="_blank" >RIV/00216224:14740/14:00073691 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.nature.com/ncomms/2014/140324/ncomms4505/pdf/ncomms4505.pdf" target="_blank" >http://www.nature.com/ncomms/2014/140324/ncomms4505/pdf/ncomms4505.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ncomms4505" target="_blank" >10.1038/ncomms4505</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The structure and substrate specificity of human Cdk12/Cyclin K
Popis výsledku v původním jazyce
Phosphorylation of the RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) by cyclin-dependent kinases is important for productive transcription. Here we determine the crystal structure of Cdk12/CycK and analyse its requirements for substrate recognition. Active Cdk12/CycK is arranged in an open conformation similar to that of Cdk9/CycT but different from those of cell cycle kinases. Cdk12 contains a C-terminal extension that folds onto the N- and C-terminal lobes thereby contacting the ATP ribose. The interaction is mediated by an HE motif followed by a polybasic cluster that is conserved in transcriptional CDKs. Cdk12/CycK showed the highest activity on a CTD substrate prephosphorylated at position Ser7, whereas the common Lys7 substitution was not recognized.Flavopiridol is most potent towards Cdk12 but was still 10-fold more potent towards Cdk9. T-loop phosphorylation of Cdk12 required coexpression with a Cdk-activating kinase.
Název v anglickém jazyce
The structure and substrate specificity of human Cdk12/Cyclin K
Popis výsledku anglicky
Phosphorylation of the RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) by cyclin-dependent kinases is important for productive transcription. Here we determine the crystal structure of Cdk12/CycK and analyse its requirements for substrate recognition. Active Cdk12/CycK is arranged in an open conformation similar to that of Cdk9/CycT but different from those of cell cycle kinases. Cdk12 contains a C-terminal extension that folds onto the N- and C-terminal lobes thereby contacting the ATP ribose. The interaction is mediated by an HE motif followed by a polybasic cluster that is conserved in transcriptional CDKs. Cdk12/CycK showed the highest activity on a CTD substrate prephosphorylated at position Ser7, whereas the common Lys7 substitution was not recognized.Flavopiridol is most potent towards Cdk12 but was still 10-fold more potent towards Cdk9. T-loop phosphorylation of Cdk12 required coexpression with a Cdk-activating kinase.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
NATURE COMMUNICATIONS
ISSN
2041-1723
e-ISSN
—
Svazek periodika
5
Číslo periodika v rámci svazku
3505
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
"nestránkováno"
Kód UT WoS článku
000334302000008
EID výsledku v databázi Scopus
—