Structural and Functional Analysis of the Cdk13/Cyclin K Complex

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00088066" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00088066 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124715014382" target="_blank" >http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124715014382</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2015.12.025" target="_blank" >10.1016/j.celrep.2015.12.025</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Structural and Functional Analysis of the Cdk13/Cyclin K Complex

Popis výsledku v původním jazyce

Cyclin-dependent kinases regulate the cell cycle and transcription in higher eukaryotes. We have determined the crystal structure of the transcription kinase Cdk13 and its Cyclin K subunit at 2.0 angstrom resolution. Cdk13 contains a C-terminal extension helix composed of a polybasic cluster and a DCHEL motif that interacts with the bound ATP. Cdk13/CycK phosphorylates both Ser5 and Ser2 of the RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) with a preference for Ser7 pre-phosphorylations at a C-terminal position. The peptidyl-prolyl isomerase Pin1 does not change the phosphorylation specificities of Cdk9, Cdk12, and Cdk13 but interacts with the phosphorylated CTD through its WW domain. Using recombinant proteins, we find that flavopiridol inhibits Cdk7 more potently than it does Cdk13. Gene expression changes after knockdown of Cdk13 or Cdk12 are markedly different, with enrichment of growth signaling pathways for Cdk13-dependent genes.

Název v anglickém jazyce

Structural and Functional Analysis of the Cdk13/Cyclin K Complex

Popis výsledku anglicky

Cyclin-dependent kinases regulate the cell cycle and transcription in higher eukaryotes. We have determined the crystal structure of the transcription kinase Cdk13 and its Cyclin K subunit at 2.0 angstrom resolution. Cdk13 contains a C-terminal extension helix composed of a polybasic cluster and a DCHEL motif that interacts with the bound ATP. Cdk13/CycK phosphorylates both Ser5 and Ser2 of the RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) with a preference for Ser7 pre-phosphorylations at a C-terminal position. The peptidyl-prolyl isomerase Pin1 does not change the phosphorylation specificities of Cdk9, Cdk12, and Cdk13 but interacts with the phosphorylated CTD through its WW domain. Using recombinant proteins, we find that flavopiridol inhibits Cdk7 more potently than it does Cdk13. Gene expression changes after knockdown of Cdk13 or Cdk12 are markedly different, with enrichment of growth signaling pathways for Cdk13-dependent genes.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Cell Reports

ISSN

2211-1247

e-ISSN

—

Svazek periodika

14

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

320-331

Kód UT WoS článku

000368101600015

EID výsledku v databázi Scopus

—