Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs

Identifikátory výsledku

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The Nuclear Exosome Targeting (NEXT) complex is a key cofactor of the mammalian nuclear exosome in the removal of Promoter Upstream Transcripts (PROMPTs) and potentially aberrant forms of other noncoding RNAs, such as snRNAs. NEXT is composed of three subunits SKIV2L2, ZCCHC8 and RBM7. We have recently identified the NEXT complex in our screen for oligo(U) RNA-binding factors. Here, we demonstrate that NEXT displays preference for U-rich pyrimidine sequences and this RNA binding is mediated by the RNA recognition motif (RRM) of the RBM7 subunit. We solved the structure of RBM7 RRM and identified two phenylalanine residues that are critical for interaction with RNA. Furthermore, we showed that these residues are required for the NEXT interaction with snRNAs in vivo. Finally, we show that depletion of components of the NEXT complex alone or together with exosome nucleases resulted in the accumulation of mature as well as extended forms of snRNAs.

  • Název v anglickém jazyce

    RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs

  • Popis výsledku anglicky

    The Nuclear Exosome Targeting (NEXT) complex is a key cofactor of the mammalian nuclear exosome in the removal of Promoter Upstream Transcripts (PROMPTs) and potentially aberrant forms of other noncoding RNAs, such as snRNAs. NEXT is composed of three subunits SKIV2L2, ZCCHC8 and RBM7. We have recently identified the NEXT complex in our screen for oligo(U) RNA-binding factors. Here, we demonstrate that NEXT displays preference for U-rich pyrimidine sequences and this RNA binding is mediated by the RNA recognition motif (RRM) of the RBM7 subunit. We solved the structure of RBM7 RRM and identified two phenylalanine residues that are critical for interaction with RNA. Furthermore, we showed that these residues are required for the NEXT interaction with snRNAs in vivo. Finally, we show that depletion of components of the NEXT complex alone or together with exosome nucleases resulted in the accumulation of mature as well as extended forms of snRNAs.

Klasifikace

  • Druh

    Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nucleic Acids Research

  • ISSN

    0305-1048

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    43

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    4236-4248

  • Kód UT WoS článku

    000355317200036

  • EID výsledku v databázi Scopus